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Enregistrement W4402883580 · doi:10.1101/2024.09.24.24314067

Severe infection among young infants in Dhaka, Bangladesh: effect of case definition on incidence estimates

2024· preprint· en· W4402883580 sur OpenAlexaff
Alastair Fung, Cole Heasley, Lisa G. Pell, Diego G. Bassani, Prakesh S Shah, Shaun K. Morris, Davidson H. Hamer, Mohammad Shahidul Islam, Abdullah Al Mahmud, Eleanor Pullenayegum, Samir K. Saha, Rashidul Haque, Md Iqbal Hossain, Chun-Yuan Chen, Abby Emdin, Karen M O’Callaghan, Miranda G. Loutet, Shamima Sultana, S M Masum Billah, S. M. Abdul Gaffar, Enamul Karim, Sharika Sayed, Sultana Yeasmin, Md. Mahbubul Hoque, Tahmeed Ahmed, Shafiqul Alam Sarker, Daniel Roth

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueCOVID-19 epidemiological studies
Établissements canadiensMount Sinai HospitalInstitute for Clinical Evaluative SciencesUniversity of TorontoSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenPublic Health Ontario
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIncidence (geometry)PediatricsMedicineDemographyMathematicsSociology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Introduction Heterogeneity in definitions of severe infection, sepsis and serious bacterial infection (SBI) in young infants limits the comparability of randomized controlled trials (RCTs) of infection prevention interventions. To inform the design of severe infection prevention RCTs for young infants in low-resource settings, we estimated the incidence of severe infection in an observational cohort of Bangladeshi infants aged 0-60 days and examined the effect of variations in case definitions on incidence estimates. Methods In 2020-2022, 1939 infants born generally healthy were enrolled at two hospitals in Dhaka, Bangladesh. Severe infection cases were identified through up to 12 scheduled community health worker home visits from 0-60 days of age or through caregiver self-referral. The primary severe infection case definition combined physician documentation of standardized clinical signs and/or diagnosis of sepsis/SBI, plus either a positive blood culture or parenteral antibiotic treatment for ≥5 days. Incidence rates were estimated for the primary severe infection definition, the World Health Organization (WHO) definition of possible SBI, blood culture-confirmed infection, and five alternative severe infection definitions. Results Severe infection incidence per 1000 infant-days was 1.2 (95% CI 0.97-1.4) using the primary definition, 0.84 (0.69-1.0) using the WHO definition of possible SBI, and 0.026 (0.0085-0.081) using blood culture-confirmed infection. One-third of cases met criteria for the primary severe infection definition through physician diagnosis of sepsis/SBI rather than the standardized clinical signs, and 85% of cases were identified following caregiver self-referral despite frequent scheduled study visits. Conclusions Severe infection incidence in young infants varied considerably by case definition. A severe infection definition that requires physician documentation of standardized clinical signs may miss a substantial proportion of cases identified by physician diagnosis of sepsis/SBI. In settings where health facilities are accessible, frequently scheduled home assessments by study personnel to identify severe infection in infants may not be necessary. What is already known on this topic Researchers aiming to design a randomized controlled trial (RCT) for severe infection prevention or treatment in young infants require a clinically precise and feasible case definition of severe infection. A previous systematic review of neonatal sepsis definitions used in RCTs identified a diverse range, including culture-confirmed sepsis, a combination of clinical signs and culture-confirmation, and a combination of clinical signs and laboratory investigation results. Incidence estimates of various severe infection case definitions that can be operationalized in low- and middle-income countries (LMICs) are needed to determine the feasibility of using these definitions in severe infection prevention and treatment RCTs for young infants in these settings. What this study adds We provide incidence estimates of severe infection in young infants born generally healthy in Dhaka, Bangladesh, during the first 60 days of age using case definitions based on different combinations of clinical signs, antibiotic treatment and microbiologic criteria. We demonstrate that the incidence estimates of severe infection in young infants vary considerably depending on whether a permissive or stringent case definition is adopted. We also demonstrate that in this study, most severe infection cases were identified following caregiver self-referral rather than during scheduled home assessments by study personnel. How this study might affect research, practice or policy Our findings may inform the design of future severe infection prevention RCTs in young infants in LMICs by 1) providing incidence estimates of various candidate case definitions, and 2) supporting the planning of optimal outcome surveillance systems that balance the identification of severe infection cases with operational costs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,120
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,333
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,120
Score d'incertitude au seuil0,633

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1200,333
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,006
Bibliométrie0,0030,004
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,127
Tête enseignante GPT0,396
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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