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Enregistrement W4402956201 · doi:10.5376/bm.2024.15.0019

Unraveling the Functional Role of R2R3-MYB Genes in Black Rice Anthocyanin Pathway: A CRISPR/Cas9 and Overexpression Study

2024· article· en· W4402956201 sur OpenAlexvenueno aff
Mengmeng Yin, Fan Luo, Xiaoli Zhou, Changhe Wei, Qian Zhu, Huirong Dong, Lijuan Chen, Dong Sun Lee

Notice bibliographique

RevueBioscience Methods · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCRISPRMYBBlack riceGeneAnthocyaninBiologyGeneticsTranscription factorBotanyEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

R2R3-OsMYBs play a pivotal role in the regulation of anthocyanin biosynthesis, which is responsible for the black pigmentation observed in rice. This paper is aimed to overview the functional mechanisms of these genes through the application of CRISPR/Cas9 gene editing and overexpression techniques. Recent studies have demonstrated the effectiveness of CRISPR/Cas9 in targeting key genes within the anthocyanin biosynthesis pathway, including OsF3'H , OsDFR , and OsLDOX , leading to significant alterations in anthocyanin content and seed color in rice. Moreover, the overexpression of R2R3-MYB  genes, such as OsC1 , has been demonstrated to increase anthocyanin production and enhance oxidative stress tolerance in rice. Comparative studies in other plant species, including tomato and Nitraria sibirica , have further illuminated the diverse regulatory roles of R2R3-MYB TFs in anthocyanin biosynthesis. This review summarizes current findings to provide a comprehensive understanding of the genetic and molecular basis of anthocyanin regulation in black rice, offering insights into potential applications for crop improvement and functional food development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,350
Écart entre enseignants0,324 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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Résumé présentoui

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