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Enregistrement W4403069460 · doi:10.1116/6.0003715

Dynamic spectroscopic and optical characterization and modeling of bovine serum albumin corona during interaction with <i>N</i>-hydroxysulfo-succinimide-covalently functionalized gold nanourchins

2024· article· en· W4403069460 sur OpenAlexaff
Mohammad E. Khosroshahi, Vaughan Woll-Morison, Kyung‐Ho Kim

Notice bibliographique

RevueBiointerphases · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Interaction Studies and Fluorescence Analysis
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryBovine serum albuminSuccinimideDynamic light scatteringAnalytical Chemistry (journal)AbsorbanceSurface plasmon resonanceChromatographyNanoparticleOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this study, bovine serum albumin (BSA) is used as a globular protein model to examine the conformational changes that occur during the interaction of BSA with N-hydroxysulfo-succinimide (sodium salt)-functionalized gold nanourchins (GNUs), for which dynamic spectroscopic techniques are employed. The results showed that the absorbance of phosphate-buffered saline-BSA at 278 nm decreased when a GNU was added to the solution due to adsorption, and it decreased further when the GNU was increased. The intensity and width of the peak of local surface plasmon resonance increased, indicating the effect of corona formation. Dynamic UV-vis spectroscopy and scattering revealed a nonlinear behavior of BSA-GNU interaction. The bioplasmonic solution resulted in higher transmission and scattering than the BSA solution. Fourier transform-near-infrared spectra exhibited several bands due to overtones and combinations of the amide group and different proportions of α-helix and β-sheet components in BSA before and after the addition of the GNU. Time-resolved fluorescence spectroscopy demonstrated an initial increase in blueshifted emission, followed by a redshifted quenching of two major peaks of Tyr and tryptophan (Trp). The binding and dissociation constants were determined as Kb = 2.17 × 1010 M-1 and Kd = 4.6 × 10-11, respectively, using the Stern-Volmer relation. Both the dynamic CMOS-based imaging and the cadmium sulfide sensors demonstrated a nonlinear response of bioplasmonic solution. By increasing the GNU, the resistance of the solution decreased in the order of A > S1 > S3, where S3 exhibited the highest initial transmission with a longer desorption time. MATLAB modeling showed 80% surface coverage by the protein in 15 s at 0.05M, equivalent to a thickness of 1.7 nm, which was in agreement with the value determined by using the Stokes-Einstein relation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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