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Enregistrement W4403209110 · doi:10.1038/s41467-024-52801-9

Transcriptional coactivator MED15 is required for beta cell maturation

2024· article· en· W4403209110 sur OpenAlexafffund
Alex Z. Kadhim, Ben Vanderkruk, Samantha Mar, Meixia Dan, Katarina Zosel, Eric E. Xu, Rachel J. Spencer, Shugo Sasaki, Xuanjin Cheng, Shannon L. J. Sproul, Thilo Speckmann, Cuilan Nian, Robyn Cullen, Rocky Shi, Dan S. Luciani, Bradford G. Hoffman, Stefan Taubert, Francis C. Lynn

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic function and diabetes
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesRegeneron PharmaceuticalsDiabetes CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of California, DavisNational Institutes of HealthGovernment of CanadaNational Human Genome Research InstituteMichael Smith Health Research BCBC Children's HospitalCanadian Institutes of Health ResearchJuvenile Diabetes Research Foundation United States of America
Mots-clésBETA (programming language)CoactivatorCell biologyBiologyComputational biologyComputer scienceGeneticsTranscription factorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mediator, a co-regulator complex required for RNA Polymerase II activity, interacts with tissue-specific transcription factors to regulate development and maintain homeostasis. We observe reduced Mediator subunit MED15 expression in endocrine hormone-producing pancreatic islets isolated from people living with type 2 diabetes and sought to understand how MED15 and Mediator control gene expression programs important for the function of insulin-producing β-cells. Here we show that Med15 is expressed during mouse β-cell development and maturation. Knockout of Med15 in mouse β-cells causes defects in β-cell maturation without affecting β-cell mass or insulin expression. ChIP-seq and co-immunoprecipitation analyses found that Med15 binds β-cell transcription factors Nkx6-1 and NeuroD1 to regulate key β-cell maturation genes. In support of a conserved role during human development, human embryonic stem cell-derived β-like cells, genetically engineered to express high levels of MED15, express increased levels of maturation markers. We provide evidence of a conserved role for Mediator in β-cell maturation and demonstrate an additional layer of control that tunes β-cell transcription factor function. The establishment of glucose-regulated insulin secretion from pancreatic β-cells requires multiple transcription factors but is incompletely understood. Here, the authors show that Mediator complex subunit MED15 is vital for this process of β-cell maturation, highlighting its role in coordinating transcriptional control of insulin production and secretion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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