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Enregistrement W4403229738 · doi:10.1111/ppl.14569

Identification of clerodane diterpene modifying cytochrome <scp>P450</scp> (<scp>CYP728D26</scp>) in <i>Salvia divinorum</i> ‐ en route to psychotropic salvinorin A biosynthesis

2024· article· en· W4403229738 sur OpenAlexafffund
Iris Ngo, Rahul Kumar, Liang Li, Seon‐Won Kim, Moonhyuk Kwon, Dae‐Kyun Ro

Notice bibliographique

RevuePhysiologia Plantarum · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant biochemistry and biosynthesis
Établissements canadiensThe Metabolomics Innovation CentreUniversity of AlbertaUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Research Foundation of KoreaRural Development AdministrationMinistry of Trade, Industry and EnergyCanterbury Medical Research FoundationNational Research Foundation
Mots-clésChemistryStereochemistryOpioid receptorDiterpeneOpioidBiochemistryReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Salvia divinorum is a hallucinogenic plant native to the Oaxaca in Mexico. The active ingredient for psychotropic effects in this plant is salvinorin A, a potent and highly selective κ‐opioid receptor agonist. Salvinorin A is distinct from other well‐known opioids, such as morphine and codeine, in that it is a non‐nitrogenous diterpenoid with no affinity for μ‐opioid receptor, the prime receptor of alkaloidal opioids. A terpene opioid that selectively targets a new opioid receptor (κ‐opioid receptor) can be instrumental in developing alternative analgesics. Elucidation of the salvinorin A biosynthetic pathway can help bio‐manufacture diverse semi‐synthetic derivatives of salvinorin A but, to date, only two enzymes in the Salvinorin A pathway have been identified. Here, we identify CYP728D26 that catalyzes a C18 oxygenation on crotonolide G, which bears a clerodane backbone. Biochemical identity of CYP728D26 was validated by in vivo reconstitution in yeast, 1H‐ and 13C‐NMR analyses of the purified product, and kinetic analysis of CYP728D26 with a Km value of 13.9 μM. Beyond the single oxygenation on C18, collision‐induced dissociation analysis suggested two additional oxygenations are catalyzed by CYP728D26 to form crotonoldie G acid, although this carboxylic acid form is a minor product. Its close homologue CYP728D25 exhibited a C1‐hydroxylation on the clerodane backbone in a reconstituted yeast system. However, CYP728D25 showed no activity in in vitro assays. This result implies that catalytic activities observed from overexpression systems should be interpreted cautiously. This work identified a new CYP catalyst and advanced our knowledge of salvinorin A biosynthesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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