Characterization of the <i>Plasmodium falciparum</i> homologue of Vps16, a member of the Vps-C tethering complex
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT The organelles of the apical complex (rhoptries, micronemes and dense granules) are critical for erythrocyte invasion by the malaria parasite Plasmodium falciparum . Though they have essential roles in the parasite lifecycle, the mechanisms behind their biogenesis are still poorly defined. The Class C Vps proteins Vps11, 16, 18 and 33 constitute the core of the CORVET and HOPS complexes implicated in vesicle tethering and fusion in the eukaryotic endolysosomal system. Work in the model apicomplexan Toxoplasma gondii has revealed that TgVps11 is essential for the generation of the apical complex. P. falciparum possesses all the four subunits of the Vps-C complex but their function is currently unknown. We here present an initial characterization of the P. falciparum orthologue of Vps16, a member of the Vps-C complex. Our structural predictions suggest that the structure of PfVps16 is similar to its other eukaryotic counterparts and that the binding region responsible for its interaction with PfVps33 is conserved. We next show that PfVps16 is expressed throughout the asexual erythrocytic cycle and that it is potentially associated with the rhoptries in schizont stage parasites. Finally, we present our unsuccessful attempts at studying its function using knock sideways.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».