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Enregistrement W4403259614 · doi:10.1016/j.geoderma.2024.117058

Assessing soil fungal diversity under different sampling schemes in conjunction with remote sensing technologies in a subtropical forest

2024· article· en· W4403259614 sur OpenAlexaff
Wanwan Yu, H. Xing, Chunchun Wang, Xinyue Cui, Xian Wu, Yu Liu

Notice bibliographique

RevueGeoderma · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycorrhizal Fungi and Plant Interactions
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSubtropicsConjunction (astronomy)Sampling (signal processing)Tropical and subtropical moist broadleaf forestsRemote sensingEnvironmental scienceDiversity (politics)Hydrology (agriculture)EcologyGeographyComputer scienceGeologyBiologyGeotechnical engineeringComputer vision

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fungi, serving as real-time bioindicators to environmental changes and stressors, are crucial for effective forest conservation and management practices under ongoing global change. However, the large-scale assessment of soil fungi still encounters challenges in striking a balance between the extensive sampling costs and the limited accuracy of minimal sampling. In this study, we analyzed 1,606 soil samples collected from 625 quadrats (20 m × 20 m) within a 25-ha subtropical forest dynamic plot in East China. Our primary objective was to explore the impact of different sampling schemes, in conjunction with remote sensing (RS) technologies, on the interpolation of soil fungal diversity using Ordinary Kriging (OK) and Co-kriging (CoK) models. Our findings suggested that a sampling scheme including points at 0 m (the base points) and 8 m within each quadrat, totaling to 26 points/ha, would be a sufficient scheme. This scheme with OK model yielded comparable results to those of more intensive schemes (at 0, 2, 5 and 8 m), but required the fewest sampling points. Upon incorporating each RS variable separately into the CoK models, including two vegetation indices (normalized difference vegetation index and transformed chlorophyll absorption ratio index 2), three terrain attributes (Elevation, Aspect and Slope), and the synthesis of these RS variables, the accuracy of the predicted results was further improved for each sampling scheme. By leveraging high-precision soil DNA sequencing in conjunction with cost-effective RS technologies, this study proposes a rapid and affordable approach for monitoring soil fungal diversity on a large scale. This will facilitate data collection for understanding responses of forest soil fungi to ongoing global change.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,042
Score d'incertitude au seuil0,084

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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