MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4403287466 · doi:10.1016/j.jlr.2024.100667

Apolipoprotein B gene expression and regulation in relation to Alzheimer’s disease pathophysiology

2024· article· en· W4403287466 sur OpenAlexafffund
Gabriel Aumont‐Rodrigue, Cynthia Picard, Anne Labonté, Judes Poirier

Notice bibliographique

RevueJournal of Lipid Research · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensDouglas Mental Health University Institute
Organismes subventionnairesNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringFonds de Recherche du Québec - SantéNational Research Council CanadaCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFondation Jean-Louis LévesqueU.S. Department of DefenseAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeNational Institute on AgingEli Lilly and CompanyF. Hoffmann-La Roche
Mots-clésPathophysiologyApolipoprotein BDiseaseGeneGene expressionAlzheimer's diseaseBiologyGeneticsMedicineInternal medicineBioinformaticsEndocrinologyCholesterol

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Apolipoprotein B (APOB), a receptor-binding protein present in cholesterol-rich lipoproteins, has been implicated in Alzheimer's disease (AD). High levels of APOB-containing low-density lipoproteins (LDL) are linked to the pathogenesis of both early-onset familial and late-onset sporadic AD. Rare coding mutations in the APOB gene are associated with familial AD, suggesting a role for APOB-bound lipoproteins in the central nervous system. This research explores APOB gene regulation across the AD spectrum using four cohorts: BRAINEAC (elderly control brains), DBCBB (controls, AD brains), ROSMAP (controls, MCI, AD brains), and ADNI (control, MCI, AD clinical subjects). APOB protein levels, measured via mass spectrometry and ELISA, positively correlated with AD pathology indices and cognition, while APOB mRNA levels showed negative correlations. Brain APOB protein levels are also correlated with cortical Aβ levels. A common coding variant in the APOB gene locus affected its expression but didn't impact AD risk or brain cholesterol concentrations, except for 24-S-hydroxycholesterol. Polymorphisms in the CYP27A1 gene, notably rs4674344, were associated with APOB protein levels. A negative correlation was observed between brain APOB gene expression and AD biomarker levels. CSF APOB correlated with Tau pathology in presymptomatic subjects, while cortical APOB was strongly associated with cortical Aβ deposition in late-stage AD. The study discusses the potential link between blood-brain barrier dysfunction and AD symptoms in relation to APOB neurobiology. Overall, APOB's involvement in lipoprotein metabolism appears to influence AD pathology across different stages of the disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,073
Tête enseignante GPT0,402
Écart entre enseignants0,329 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Lipid ResearchMême sujetAlzheimer's disease research and treatmentsTravaux en français237 207