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Enregistrement W4403301260 · doi:10.1002/tax.13264

Molecular systematics of <i>Cuscuta</i> subgenus <i>Monogynella</i> (Convolvulaceae) based on plastid and nuclear sequences

2024· article· en· W4403301260 sur OpenAlexafffund
Asawari Albal, Mihai Costea, Saša Stefanović

Notice bibliographique

RevueTaxon · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Parasitism and Resistance
Établissements canadiensWilfrid Laurier UniversityUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaRussian Academy of SciencesKomarov Botanical Institute, Russian Academy of Sciences
Mots-clésCuscutaConvolvulaceaeSubgenusBotanySystematicsPlastidBiologyTaxonomy (biology)Genetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Cuscuta (dodders) consists of ~200 species circumscribed into four subgenera ( C. subg. Cuscuta , subg. Grammica , subg. Monogynella , subg. Pachystigma ) and is the only parasitic genus in Convolvulaceae (the morning‐glory family). This genus shows a significant diversity in plastid functionality and represents a rare mixotrophic system within parasitic plants, where different trophic modes can be found at a lower phylogenetic level. Cuscuta subg. Monogynella contains chlorophyllous hemiparasitic species distributed primarily across Eurasia, with Central Asia as its center of diversity. Apart from a few placeholders in broad‐scale phylogenies, this group has not been extensively sampled and studied taxonomically, morphologically, or geographically. Our paper presents the first in‐depth phylogeny for C. subg. Monogynella based on plastid trnL‐F and nuclear ITS sequence regions. Our wide taxon sampling included 12 out of the 15 presently recognized species, with specimens from across their geographic distribution. Our analyses show highly congruent trees, forming similar clades using both plastid and nuclear markers, with no indication of hybridization. Most of the species, represented by multiple individuals from various geographic regions, have been found reciprocally monophyletic or paraphyletic. One individual from south‐west China formed its own separate lineage, with substantial branch length subtending it, and given its distinct geographic distribution, likely belongs to a new species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,621
Score d'incertitude au seuil0,183

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,195
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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