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Enregistrement W4403318926 · doi:10.1364/optica.534148

Vortex light field microscopy: 3D spectral single-molecule imaging with a twist

2024· article· en· W4403318926 sur OpenAlexaff
Boya Zhang, Sam Daly, Chengxi Zhu, Martin O. Lenz, Lucien E. Weiss, Lisa-Maria Needham, Ruby Peters, Steven F. Lee, Kevin O’Holleran

Notice bibliographique

RevueOptica · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueNear-Field Optical Microscopy
Établissements canadiensPolytechnique Montréal
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilEngineering and Physical Sciences Research CouncilDirectorate for Biological Sciences
Mots-clésTwistMicroscopyVortexDark field microscopyPhysicsMaterials scienceOpticsMolecular physicsGeometryMechanicsMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

3D single-molecule imaging reveals nanoscale structures in cell volumes but is limited by the need for spectrally distinct fluorophores. We address this limitation with vortex light field microscopy (VLFM), a 3D spectral single-molecule localization technique with 25 nm spatial and 3 nm spectral precision over a 4 µm depth of field. By modifying our previous single-molecule light field microscope with an azimuthally oriented prism array, we generated spectral disparity orthogonal to axial disparity, enabling simultaneous spatial and spectral localization on a single detector. We demonstrate VLFM with four-color 3D single-particle tracking and two-color 3D dSTORM imaging in fixed cells, successfully identifying dyes with spectral peaks just 15 nm apart. This shows VLFM’s potential for enhancing spatial biology workflows requiring highly multiplexed imaging.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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