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Enregistrement W4403378348 · doi:10.1101/2024.10.08.617317

Bio-engineering a common probiotic to exploit colonic inflammation promotes reliable efficacy in translational models of colitis

2024· preprint· en· W4403378348 sur OpenAlexaff
Andrea Verdugo‐Meza, Sandeep K. Gill, Artem Godovannyi, Malavika K. Adur, Jacqueline A. Barnett, Mehrbod Estaki, Jiayu Ye, Natasha Haskey, Hannah Mehain, Jessica Josephson, Ray Ishida, Chanel Ghesquiere, Laura M. Sly, Deanna L. Gibson

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British Columbia, Okanagan CampusKelowna General HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésColitisProbioticInflammationImmune systemMicrobiomeImmunologyInflammatory bowel diseaseDiseaseMedicineUlcerative colitisBiologyBacteriaBioinformaticsInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The intricate balance between the gut microbiome and host health inspires innovations in drug development. Commensal bacteria provide a multi-targeted approach ideal for treating complex medical conditions, like inflammatory bowel disease (IBD). These bacteria are self-replicating factories with broad targets that promote balanced intestinal inflammation, mucosal barrier function, and eubiosis. Yet, the lack of superiority to gold-standard treatments and their clinical inconsistency makes most probiotics unreliable for disease treatments. Intestinal inflammation, a driving factor in many diseases, often overwhelms commensal bacteria, which lack the stress-resistance mechanisms necessary to withstand host immune defenses. To address this, we introduced a persistence platform BioPersist™ into E. coli Nissle 1917. We hypothesized that a bio-engineered probiotic, or genetically engineered microbial medicine (GEMM™), designed to persist during inflammation would enhance probiotic bioavailability during colitis, leading to sustained therapeutic outcomes. We evaluated BioPersist in multiple translational colitis models such as in mice and pigs. BioPersist delayed the onset and reduced the severity of both chronic and acute colitis, proving more effective than 5-aminosalicylate. BioPersist thrived during inflammation promoting tolerogenic immune responses that limited infiltrating leukocyte activity and decreased TNF-α from resident myeloid cells in the mesentery. The persistence feature of BioPersist allowed the probiotic to overcome the damaging inflammatory response, eliciting mucosal healing evident by the increase in microbially-derived butyric acid. Based on these preclinical results, BioPersist may be a novel therapeutic option for both human and veterinary applications that sustains efficacy during colitis. One Sentence Summary Adding a persistence feature to a probiotic enhances its efficacy for colitis treatment, enhancing future human and veterinary therapeutic applications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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