Dissecting causal relationships between immune cells, blood metabolites, and aortic dissection: A mediation Mendelian randomization study
Notice bibliographique
Résumé
Background: There exists a robust correlation between the infiltration of immune cells and the pathogenesis of aortic dissection (AD). Moreover, blood metabolites serve as immunomodulatory agents within the organism, influencing the immune system's response and potentially playing a role in the development of AD. Nevertheless, the intricate genetic causal nexus between specific immune cells, blood metabolites, and AD remains partially elucidated. Objectives: This study aims to elucidate the causal relationships between specific immune cell types and the risk of developing AD, mediated by blood metabolites, using Mendelian Randomization (MR) methods. Methods: We undertook a comprehensive investigation of 731 immune cell types through the analysis of published genome-wide association studies (GWAS). Our methodology hinged on the application of two-sample Mendelian randomization (MR) and mediator MR analyses, prioritizing blood metabolites as potential intermediary factors and AD as the principal outcome of interest. The primary statistical method employed was inverse variance-weighted estimation, complemented by a variety of sensitivity analyses to reinforce our conclusions. The entirety of our statistical analyses was executed on the R software platform. Results: Our analyses elucidated that three immune cell types exhibited a positive correlation with the incidence of AD, whereas two immune cell types were inversely associated with AD risk. Significantly, our mediation Mendelian randomization (MR) findings identified Benzoate as a pivotal mediator in the influence of CD19 on IgD - CD38br cells on AD, with a mediation proportion of 5.38 %. Additionally, N-acetylproline was determined to mediate the effect of CD24 on IgD- CD38- cells on AD, accounting for a mediation proportion of 13.70 %. Furthermore, Carnitine C5:1 was found to mediate the effect of CD28 on secreting T regulatory (Treg) cells on AD, with a mediation proportion of 17.80 %. Conclusions: These findings offer a nuanced understanding of the pathophysiological mechanisms underlying AD, thereby advancing the precision medicine paradigm in the clinical management of AD.Abbreviations: AD: aortic dissection; AA: aortic aneurysm; GWAS: genome-wide association study; MR: Mendelian randomization; TSMR: two-step Mendelian randomization; Treg: secreting T regulatory cell; VSMC: vascular smooth muscle cell; MMP: matrix metalloproteinase; ROS: reactive oxygen species; IV: instrumental variable; SNP: single-nucleotide polymorphism; IVW: inverse variance weighted; LDSC: linkage disequilibrium score regression; OR: odds ratio; CI: confidence interval; LD: linkage disequilibrium; AC: absolute cell; MFI: median fluorescence intensity; MP: morphological parameter; RC: relative cell; CLSA: Canadian Longitudinal Study of Aging; Lp(a): Lipoprotein a; OxPL: oxidised phospholipid; NMDAR: N-methyl-d-aspartate glutamate receptor; STROBE-MR: Strengthening the Reporting of Observational Studies in Epidemiology using Mendelian Randomization.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,045 | 0,056 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,005 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».