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Enregistrement W4403402517 · doi:10.7717/peerj.18229

World of Crayfish™: a web platform towards real-time global mapping of freshwater crayfish and their pathogens

2024· article· en· W4403402517 sur OpenAlexaff
Mihaela C. Ion, Caitlin C. Bloomer, Tudor I. Bărăscu, Francisco J. Oficialdegui, Nathaniel F. Shoobs, Bronwyn W. Williams, Kevin Scheers, Miguel Clavero, Frédéric Grandjean, Marc Collas, Thomas Baudry, Zachary J. Loughman, Jeremy J. Wright, Timo J. Ruokonen, Christoph Chucholl, Simone Guareschi, Bram Koese, Zsombor Bányai, James Hodson, Margo Hurt, Katrin Kaldre, Boris Lipták, James W. Fetzner, Tommaso Cancellario, András Weiperth, Jānis Birzaks, Teodora Trichkova, Milcho Todorov, Maksims Balalaikins, Bogna Griffin, О. Н. Петко, Ada Acevedo, Guillermo D’Elía, Karolina Śliwińska, Anatoly Alekhnovich, Henry Choong, Josie South, Nick S. Whiterod, Katarina Zorić, Peter Haase, Ismael Soto, Daniel J. Brady, Phillip J. Haubrock, Pedro J. Torres, Denis Şadrin, Pavel Vlach, Çüneyt Kaya, Sang Woo Jung, Jin‐Young Kim, Xavier Vermeersch, Maciej Bonk, Radu Cornel Guiașu, Muzaffer Mustafa Harlıoğlu, Jane Devlin, Irmak Kurtul, Dagmara Błońska, Pieter Boets, Hossein Masigol, Paul R. Cabe, Japo Jussila, Trude Vrålstad, David Beresford, Scott M. Reid, Jiří Patoka, David Strand, Ali Serhan Tarkan, Frédérique Steen, Thomas Abeel, Matthew Harwood, Samuel Auer, Sandor L. Kelly, Ioannis A. Giantsis, Rafał Maciaszek, Maria V. Alvanou, Önder Aksu, David M. Hayes, Tadashi Kawai, Elena Tricarico, Adroit T. Chakandinakira, Zanethia C. Barnett, Ştefan G. Kudor, Andreea E. Beda, Lucian Vîlcea, Alexandru Eugeniu Mizeranschi, Marian Neagul, Anton Licz, Andra D. Cotoarbă, Adam Petrusek, Antonín Kouba, Christopher A. Taylor, Lucian Pârvulescu

Notice bibliographique

RevuePeerJ · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueCrustacean biology and ecology
Établissements canadiensTrent UniversityYork UniversityMinistry of Natural Resources and ForestryRoyal British Columbia Museum
Organismes subventionnairesColegiul Consultativ pentru Cercetare-Dezvoltare şi InovareUnitatea Executiva pentru Finantarea Invatamantului Superior, a Cercetarii, Dezvoltarii si InovariiMinisterul Cercetării, Inovării şi Digitalizării
Mots-clésCrayfishBiologyEcologyFisheryZoologyData scienceGeographyComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Freshwater crayfish are amongst the largest macroinvertebrates and play a keystone role in the ecosystems they occupy. Understanding the global distribution of these animals is often hindered due to a paucity of distributional data. Additionally, non-native crayfish introductions are becoming more frequent, which can cause severe environmental and economic impacts. Management decisions related to crayfish and their habitats require accurate, up-to-date distribution data and mapping tools. Such data are currently patchily distributed with limited accessibility and are rarely up-to-date. To address these challenges, we developed a versatile e-portal to host distributional data of freshwater crayfish and their pathogens (using Aphanomyces astaci, the causative agent of the crayfish plague, as the most prominent example). Populated with expert data and operating in near real-time, World of Crayfish™ is a living, publicly available database providing worldwide distributional data sourced by experts in the field. The database offers open access to the data through specialized standard geospatial services (Web Map Service, Web Feature Service) enabling users to view, embed, and download customizable outputs for various applications. The platform is designed to support technical enhancements in the future, with the potential to eventually incorporate various additional features. This tool serves as a step forward towards a modern era of conservation planning and management of freshwater biodiversity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Logiciel · Signal consensuel: Logiciel
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,053

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0060,003
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0030,004
Science ouverte0,0020,005
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0160,015

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreLogiciel

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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