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Enregistrement W4403452644 · doi:10.1038/s41598-024-72968-x

Bridging big data in the ENIGMA consortium to combine non-equivalent cognitive measures

2024· article· en· W4403452644 sur OpenAlexaff
Eamonn Kennedy, Shashank Vadlamani, Hannah M. Lindsey, Pui‐Wa Lei, Mary Jo Pugh, Paul M. Thompson, David F. Tate, Frank G. Hillary, Emily L. Dennis, Elisabeth A. Wilde, Maheen M. Adamson, Martin Alda, Sílvia Alonso-Lana, Sonia Ambrogi, Tim Anderson, Celso Arango, Robert F. Asarnow, Mihai Avram, Rosa Ayesa‐Arriola, Talin Babikian, Nerisa Banaj, Laura Bird, Stefan Borgwardt, Amy Brodtmann, Katharina Brosch, Karen Caeyenberghs, Vince D. Calhoun, Nancy D. Chiaravalloti, David X. Cifu, Benedicto Crespo‐Facorro, John C. Dalrymple‐Alford, Kristen Dams-O’Connor, Udo Dannlowski, David Darby, Nicholas D. Davenport, John DeLuca, Covadonga M. Díaz‐Caneja, Seth G. Disner, Ekaterina Dobryakova, Stefan Ehrlich, Carrie Esopenko, Fabio Ferrarelli, Lea E. Frank, Carol E. Franz, Paola Fuentes‐Claramonte, Helen M. Genova, Christopher C. Giza, Janik Goltermann, Dominik Grotegerd, Marius Gruber, Alfonso Gutiérrez‐Zotes, Minji Ha, Jan Haavik, Charles H. Hinkin, Kristen R. Hoskinson, Daniela Hubl, Andrei Irimia, Andreas Jansen, Michael Kaess, Xiaojian Kang, Kimbra Kenney, Barbora Keřková, Mohamed Salah Khlif, Minah Kim, Jochen Kindler, Tilo Kircher, Karolína Knížková, Knut K. Kolskår, Denise Krch, William S. Kremen, Taylor Kuhn, Veena Kumari, Jun Soo Kwon, Sarah Laskowitz, Jungha Lee, Jean Lengenfelder, Spencer W. Liebel, Victoria Liou‐Johnson, Sara M. Lippa, Marianne Løvstad, Astri J. Lundervold, Cassandra Marotta, Craig A. Marquardt, Paulo Mattos, Ahmad Mayeli, Carrie R. McDonald, Susanne Meinert, Tracy R. Melzer, Jessica Merchán‐Naranjo, Chantal Michel, Rajendra A. Morey, Benson Mwangi, Daniel J. Myall, Igor Nenadić, Mary R. Newsome, Abraham Nunes, Terence J. O’Brien, Viola Oertel, John Ollinger, Alexander Olsen, Víctor Ortiz‐García de la Foz, Mustafa Ozmen, Heath Pardoe, Marise B. Parent, Fabrizio Piras, Federica Piras, Edith Pomarol‐Clotet, Jonathan Repple, Geneviève Richard, Jonathan Rodríguez, Mabel Rodríguez, Kelly Rootes-Murdy, Jared A. Rowland, Nicholas P. Ryan, Raymond Salvador, Anne‐Marthe Sanders, André Schmidt, Jair C. Soares, Gianfranco Spalleta, Filip Španiel, Alena Stasenko, Frederike Stein, Benjamin Straube, April D. Thames, Florian Thomas‐Odenthal, Sophia I. Thomopoulos, Erin B. Tone, Ivan J. Torres, Maya Troyanskaya, Jessica A. Turner, Kristine M. Ulrichsen, Guillermo E. Umpierrez, Elisabet Vilella, Lucy Vivash, William C. Walker, Emilio Werden, Lars T. Westlye, Krista Wild, Adrian Wroblewski, Mon‐Ju Wu, Glenn R. Wylie, Lakshmi N. Yatham, Giovana Zunta‐Soares

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensBC Mental Health & Substance Use ServicesUniversity of British ColumbiaDalhousie University
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringNational Center for Research ResourcesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesNational Institute of Mental HealthNational Institute on AgingNational Institutes of HealthZonMwU.S. Department of Veterans Affairs
Mots-clésBridging (networking)CognitionComputer scienceBig dataData scienceData miningPsychologyNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Investigators in neuroscience have turned to Big Data to address replication and reliability issues by increasing sample size. These efforts unveil new questions about how to integrate data across distinct sources and instruments. The goal of this study was to link scores across common auditory verbal learning tasks (AVLTs). This international secondary analysis aggregated multisite raw data for AVLTs across 53 studies totaling 10,505 individuals. Using the ComBat-GAM algorithm, we isolated and removed the component of memory scores associated with site effects while preserving instrumental effects. After adjustment, a continuous item response theory model used multiple memory items of varying difficulty to estimate each individual's latent verbal learning ability on a single scale. Equivalent raw scores across AVLTs were then found by linking individuals through the ability scale. Harmonization reduced total cross-site score variance by 37% while preserving meaningful memory effects. Age had the largest impact on scores overall (- 11.4%), while race/ethnicity variable was not significant (p > 0.05). The resulting tools were validated on dually administered tests. The conversion tool is available online so researchers and clinicians can convert memory scores across instruments. This work demonstrates that global harmonization initiatives can address reproducibility challenges across the behavioral sciences.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,217
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,382
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,217
Score d'incertitude au seuil0,966

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2170,382
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,004
Bibliométrie0,0120,017
Études des sciences et des technologies0,0020,004
Communication savante0,0110,007
Science ouverte0,0040,022
Intégrité de la recherche0,0020,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,136
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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