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Enregistrement W4403516036 · doi:10.1186/s12985-024-02508-6

Resistance gene Ty-1 restricts TYLCV infection in tomato by increasing RNA silencing

2024· article· en· W4403516036 sur OpenAlexaff
Xiaofang Ma, Yijun Zhou, Liming Wu, Peter Moffett

Notice bibliographique

RevueVirology Journal · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésRNA silencingBiologyNicotiana benthamianaRNA-induced transcriptional silencingRNA-induced silencing complexTrans-acting siRNAArgonauteRNAGene silencingTomato yellow leaf curl virusRNA interferenceRNA-dependent RNA polymeraseSmall interfering RNAVirologyGeneticsGenePlant virusVirus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A major antiviral mechanism in plants is mediated by RNA silencing through the action of DICER-like (DCL) proteins, which cleave dsRNA into discrete small RNA fragments, and ARGONAUTE (AGO) proteins, which use the small RNAs to target single-stranded RNA. RNA silencing can also be amplified through the action of RNA-dependent RNA polymerases (RDRs), which use single stranded RNA to generate dsRNA that in turn is targeted by DCL proteins. As a counter-defense, plant viruses encode viral suppressors of RNA silencing (VSRs) that target different components in the RNA silencing pathway. The tomato Ty-1 gene confers resistance to the DNA virus tomato yellow leaf curl virus (TYLCV) and has been reported to encode an RDRγ protein. However, the molecular mechanisms by which Ty-1 controls TYLCV infection, including whether Ty-1 is involved in RNA silencing, are unknown. Here, by using a transient expression assay, we have confirmed that Ty-1 shows antiviral activity against TYLCV in Nicotiana benthamiana. Also, in transient expression-based silencing assays, Ty-1 augmented systemic transgene silencing in GFP transgenic N. benthamiana plants. Furthermore, co-expression of Ty-1 or other RDRγ proteins from N. benthamiana or Arabidopsis with various proteins resulted in lower protein expression. These results are consistent with a model wherein Ty-1-mediated resistance to TYLCV is due, at least in part, to an increase in RNA silencing activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,895
Score d'incertitude au seuil0,225

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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