Omics analysis reveals galectin-3 to be a potential key regulator of allergic inflammation in hereditary angioedema
Notice bibliographique
Résumé
Background: Hereditary angioedema (HAE) is a rare inherited disorder that predisposes an individual to develop vasogenic edema. Bradykinin release, which increases vascular permeability, results in angioedema. C1 esterase inhibitor (C1-INH) is a major regulator of critical enzymes involved in bradykinin generation and mutations in genes that encode the C1 inhibitor of complement factor 1, which prevent its synthesis (type I HAE), form a dysfunctional protein (type II HAE), or have normal functioning C1-INH (type III HAE, aka HAE-III). Objectives: The goals of this study were to use a systems biology analysis to identify novel biomarkers to aid in the diagnosis of HAE-III and to elucidate its underlying pathogenic mechanisms. Methods: Blood samples were obtained from HAE-III subjects and age- and sex-matched healthy controls. DNA, RNA, and protein purified from the samples were subjected to multiomics analysis using a 1-shot liquid chromatography-mass spectrometry-based multiomics platform (Omni-MS, Dalton Bioanalytics) to profile proteins, lipids, electrolytes, and metabolites enabling concurrent analysis of diverse analyte classes. Results: A total of 1647 novel identifications that included genes, proteins, and metabolites were made when comparing HAE-III samples to control samples. Our identification library included MSFragger for protein identification, LipiDex for lipid identification, and Compound Discoverer for metabolite identification, enabling differential expression analysis. Key findings included a significant increase in the expression levels of galectin-3, lysosomal α-glucosidase, platelet factor 4, and platelet-derived growth factor subunit A in HAE-III subjects compared to controls, all of which generate an immunomodulatory response. Conclusion: Galectin-3 plays a critical role in eosinophil recruitment and airway allergic inflammation. It may contribute to chronic inflammation and fibrosis resulting in leaky vasculature, and it could be a potential therapeutic target in HAE-III.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».