MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4403679882 · doi:10.1016/j.bbadis.2024.167548

Thioredoxin-1 protein interactions in neuronal survival and neurodegeneration

2024· article· en· W4403679882 sur OpenAlexafffund
M. Rabiul Islam, Shakila Sultana, Nirmala Padmanabhan, Mahamud‐ur Rashid, Tabrez J. Siddiqui, Kevin M. Coombs, Peter F. Vitiello, Soheila Karimi‐Abdolrezaee, Eftekhar Eftekharpour

Notice bibliographique

RevueBiochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Basis of Disease · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRedox biology and oxidative stress
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesInstitute of Neurosciences, Mental Health and AddictionNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésNeurodegenerationThioredoxinNeuroscienceBiologyMedicineOxidative stressDiseaseInternal medicineBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Neuronal cell death remains the principal pathophysiologic hallmark of neurodegenerative diseases and the main challenge for treatment strategies. Thioredoxin1 (Trx1) is a major cytoplasmic thiol oxidoreductase protein involved in redox signaling, hence a crucial player in maintaining neuronal health. Trx1 levels are notably reduced in neurodegenerative diseases including Alzheimer's and Parkinson's diseases, however, the impact of this decrease on neuronal physiology remains largely unexplored. This is mainly due to the nature of Trx1 redox regulatory role which is afforded by a rapid electron transfer to its oxidized protein substrates. During this reaction, Trx1 forms a transient bond with the oxidized disulfide bond in the substrate. This is a highly fast reaction which makes the identification of Trx1 substrates a technically challenging task. In this project, we utilized a transgenic mouse model expressing a Flag-tagged mutant form of Trx1 that can form stable disulfide bonds with its substrates, hence allowing identification of the Trx1 target proteins. Autophagy is a vital housekeeping process in neurons that is critical for degradation of damaged proteins under oxidative stress conditions and is interrupted in neurodegenerative diseases. Given Trx1's suggested involvement in autophagy, we aimed to identify potential Trx1 substrates following pharmacologic induction of autophagy in primary cortical neurons. Treatment with rapamycin, an autophagy inducer, significantly reduced neurite outgrowth and caused cytoskeletal alterations. Using immunoprecipitation and mass spectrometry, we have identified 77 Trx1 target proteins associated with a wide range of cellular functions including cytoskeletal organization and neurodegenerative diseases. Focusing on neuronal cytoskeleton organization, we identified a novel interaction between Trx1 and RhoB which was confirmed in genetic models of Trx1 downregulation in primary neuronal cultures and HT22 mouse immortalized hippocampal neurons. The applicability of these findings was also tested against the publicly available proteomic data from Alzheimer's patients. Our study uncovers a novel role for Trx1 in regulating neuronal cytoskeleton organization and provides a mechanistic explanation for its multifaceted role in the physiology and pathology of the nervous system, offering new insights into the molecular mechanisms underlying neurodegeneration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBiochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Basis of DiseaseMême sujetRedox biology and oxidative stressTravaux en français237 207