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Enregistrement W4403777594 · doi:10.1111/geb.13917

<scp>FreshLanDiv</scp>: A Global Database of Freshwater Biodiversity Across Different Land Uses

2024· article· en· W4403777594 sur OpenAlexaff
Minghua Shen, Roel van Klink, Alban Sagouis, Danielle Katharine Petsch, Deborah A. Abong’o, Janne Alahuhta, Salman Abdo Al‐Shami, Laura Cecilia Armendáriz, Mi‐Jung Bae, Tiago Octavio Begot, Jérôme Belliard, Jonathan P. Benstead, Francieli de Fátima Bomfim, Emile Bredenhand, William R. Budnick, Marcos Callisto, Lenize Batista Calvão, Claudia Patricia Camacho Rozo, Miguel Cañedo‐Argüelles, Fernando Geraldo de Carvalho, Jacqueline M. Chapman, Lauren J. Chapman, Qiuwen Chen, Barry Chernoff, Luciana Cibils‐Martina, Gerard P. Closs, Juliano José Corbi, Erlane José Cunha, Almir Manoel Cunico, Patricio De los Ríos-Escalante, Sylvain Dolédec, Bárbara Dunck, Augustine Ovie Edegbene, Augustin C. Engman, Tibor Erős, Katharina Eichbaum Esteves, Ruan Carlos Pires Faquim, Ana Paula Justino Faria, Cláudia Maris Ferreira, Márcio Cunha Ferreira, Pablo Fierro, Pâmela V. Freitas, Vincent Fugère, Thiago Deruza Garcia, Xingli Giam, Gabriel Murilo Ribeiro Gonino, Juan David González‐Trujillo, Éder André Gubiani, Neusa Hamada, Roger J. Haro, Luiz Ubiratan Hepp, Guido A. Herrera‐R, Matthew J. Hill, Carlos Iñiguez‐Armijos, Aurélien Jamoneau, Micael Jonsson, Leandro Juen, Wilbert T. Kadye, Kahirun Kahirun, Aventino Kasangaki, Chad A. Larson, Alexandre Leandro Pereira, Thibault Leboucher, Gustavo Figueiredo Marques Leite, Dunhai Li, Ana Luiza‐Andrade, Sarah H. Luke, Matthew J. Lundquist, Daniela Lupi, Jorge Machuca‐Sepúlveda, Messias Alfredo Macuiane, Néstor Javier Mancera-Rodrı́guez, Javier A. Márquez, Renato Tavares Martins, Frank O. Masese, Marcia S. Meixler, Thaísa Sala Michelan, María José Monge‐Salazar, Joseph L. Mruzek, Hernán Mugni, Hilton G.T. Ndagurwa, Augustine Suh Niba, Jorge Nimptsch, Rodolfo Novelo‐Gutiérrez, Hannington Ochieng, Rodrigo I. Pacheco-Díaz, Young‐Seuk Park, Sophia I. Passy, Richard G. Pearson, Alexandre Peressin, Eduardo Périco, Mateus Marques Pires, Helen M. Poulos, Romina E. Príncipe, Bruno da Silveira Prudente, Blanca Ríos‐Touma, Renata Ruaro, Juan J. Schmitter‐Soto, Fabiana Schneck, Uwe Horst Schulz, C. Selvakumar, Chhatra Mani Sharma, Tadeu Siqueira, Marina Solís, Raniere Garcez Costa Sousa, Emily H. Stanley, Csilla Stenger‐Kovács, Évelyne Tales, Fabrício Barreto Teresa, Ian Thornhill, Juliette Tison‐Rosebery, Thiago Bernardi Vieira, Sebastián Villada‐Bedoya, James C. White, Paul J. Wood, Zhicai Xie, Catherine M. Yule, João Antônio Cyrino Zequi, Jonathan M. Chase

Notice bibliographique

RevueGlobal Ecology and Biogeography · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueFish Ecology and Management Studies
Établissements canadiensUniversité du Québec à Trois-RivièresCarleton UniversityMcGill UniversityWilfrid Laurier University
Organismes subventionnairesNational Research, Development and Innovation OfficeDeutsches Zentrum für integrative Biodiversitätsforschung Halle-Jena-LeipzigNemzeti Kutatási Fejlesztési és Innovációs HivatalFundação de Amparo à Pesquisa do Estado do AmazonasChina Scholarship CouncilDeutsche ForschungsgemeinschaftConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoBiodiversa+
Mots-clésMacrophyteBiodiversityAbundance (ecology)GeographyEcologyTaxonWetlandLand useMetadataDatabaseFreshwater fishFish <Actinopterygii>BiologyFishery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Motivation Freshwater ecosystems have been heavily impacted by land‐use changes, but data syntheses on these impacts are still limited. Here, we compiled a global database encompassing 241 studies with species abundance data (from multiple biological groups and geographic locations) across sites with different land‐use categories. This compilation will be useful for addressing questions regarding land‐use change and its impact on freshwater biodiversity. Main Types of Variables Contained The database includes metadata of each study, sites location, sample methods, sample time, land‐use category and abundance of each taxon. Spatial Location and Grain The database contains data from across the globe, with 85% of the sites having well‐defined geographical coordinates. Major Taxa and Level of Measurement The database covers all major freshwater biological groups including algae, macrophytes, zooplankton, macroinvertebrates, fish and amphibians.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,039
Score d'incertitude au seuil0,131

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0200,040
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0390,013

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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