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Enregistrement W4403782001 · doi:10.1016/j.jconrel.2024.10.047

Optimizing lipid nanoparticles for fetal gene delivery in vitro, ex vivo, and aided with machine learning

2024· article· en· W4403782001 sur OpenAlexaff
Amr Abostait, Mahmoud Abdelkarim, Zeqing Bao, Yuichiro Miyake, Wai Hei Tse, Caterina Di Ciano-Oliveir, Tina Buerki‐Thurnherr, Christine Allen, Richard Keijzer, Hagar I. Labouta

Notice bibliographique

RevueJournal of Controlled Release · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Interference and Gene Delivery
Établissements canadiensOccupational Cancer Research CentreChildren's Hospital Research Institute of ManitobaUniversity of TorontoHealth Sciences Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTransplacentalFetusTransfectionPlacentaIn vitroEx vivoChemistryCell biologyBiologyBiophysicsCell culturePregnancyBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

There is a clinical need to develop lipid nanoparticles (LNPs) to deliver congenital therapies to the fetus during pregnancy. The aim of these therapies is to restore normal fetal development and prevent irreversible conditions after birth. As a first step, LNPs need to be optimized for transplacental transport, safety on the placental barrier and fetal organs and transfection efficiency. We developed and characterized a library of LNPs of varying compositions and used machine learning (ML) models to delineate the determinants of LNP size and zeta potential. Utilizing different in vitro placental models with the help of a Random Forest algorithm, we could identify the top features driving percentage LNP transport and kinetics at 24 h, out of a total of 18 input features represented by 41 LNP formulations and 48 different transport experiments. We further evaluated the LNPs for safety, placental cell uptake, transfection efficiency in placental trophoblasts and fetal lung fibroblasts. To ensure the integrity of the LNPs following transplacental transport, we screened LNPs for transport and transfection using a high-throughput integrated transport-transfection in vitro model. Finally, we assessed toxicity of the LNPs in a tracheal occlusion fetal lung explant model. LNPs showed little to no toxicity to fetal and placental cells. Immunoglobin G (IgG) orientation on the surface of LNPs, PEGylated lipids, and ionizable lipids had significant effects on placental transport. The Random Forest algorithm identified the top features driving LNPs placental transport percentage and kinetics. Zeta potential emerged in the top driving features. Building on the ML model results, we developed new LNP formulations to further optimize the transport leading to 622 % increase in transport at 24 h versus control LNP formulation. To induce preferential siRNA transfection of fetal lung, we further optimized cationic lipid percentage and the lipid-to-siRNA ratio. Studying LNPs in an integrated placental and fetal lung fibroblasts model showed a strong correlation between zeta potential and fetal lung transfection. Finally, we assessed the toxicity of LNPs in a tracheal occlusion lung explant model. The optimized formulations appeared to be safe on ex vivo fetal lungs as indicated by insignificant changes in apoptosis (Caspase-3) and proliferation (Ki67) markers. In conclusion, we have optimized an LNP formulation that is safe, with high transplacental transport and preferential transfection in fetal lung cells. Our research findings represent an important step toward establishing the safety and effectiveness of LNPs for gene delivery to the fetal organs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,036
Score d'incertitude au seuil0,391

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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