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Enregistrement W4403823715 · doi:10.1093/eurpub/ckae144.1950

Evaluating Genetic Testing: A Systematic Review of Assessment Frameworks

2024· review· en· W4403823715 sur OpenAlexaboutno aff
Valentina Baccolini, Giuseppe Migliara, Antonio Sciurti, Agnieszka Kamińska, Arianna Anniballo, Andrea Pistollato, Erica Pitini, Carolina Marzuillo, Giuseppe La Torre, Paolo Villari

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Public Health · 2024
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenetic testingMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction The assessment of the risks and benefits of genetic/genomic tests has long been addressed using various frameworks. They are mostly ACCE-based, focus on technical aspects, but often overlook economic and organizational considerations. The few HTA-based approaches, though more comprehensive, lack validation and implementation. This review’s purpose is to identify all evaluation frameworks for genetic/genomic tests and synthesize their key aspects. Methods PubMed, Scopus, Web of Science, and Google Scholar were searched. Inclusion criteria were documents describing evaluation frameworks for genetic/genomic tests, that were original, specifically created, and covering at least three assessment domains. This study was supported by the EC and MUR under PNRR - M4C2-I1.3 Project PE_00000019 ‘HEAL ITALIA’. Results Overall, 12546 unique records were screened, of which 67 documents were assessed for eligibility. A total of 29 studies were included, reporting 24 different frameworks. These frameworks were published between 2000 and 2019, mostly from USA (50%), Canada (13%) and UK (13%). There was substantial interest in the economic facets of the technology (92%), albeit without extensive detail, and high attention was given to its technical accuracy (70-90%). The clinical value was also consistently mentioned (70-90%), similarly to legal, ethical, and social considerations (70-80%). However, there was minimal emphasis on non-health outcomes (20-50%), and insufficient attention to organizational, educational, and implementation barriers (20-50%). Discussion A pressing need exists for a universally accepted evaluation framework for genetic/genomic tests. Applying a general HTA methodology, potentially based on the EUnetHTA core model, that can integrate solid theoretical and methodological principles, and result in a validated, comprehensive, and widely shared tool for genetic test evaluation, is a viable option to foster the implementation of these technologies. Key messages • Genetic/genomic test evaluations focus on technical accuracy and clinical value, often missing economic and organizational aspects. • A universal, validated, HTA-based evaluation framework for genetic/genomic tests is needed to enhance their implementation in clinical practice.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,100
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,290
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,100
Score d'incertitude au seuil0,531

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1000,290
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0100,012
Bibliométrie0,0420,032
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0070,008
Science ouverte0,0050,005
Intégrité de la recherche0,0030,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,223
Tête enseignante GPT0,486
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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