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Enregistrement W4403835216 · doi:10.1681/asn.2024npy5y3y7

Pax2 Mutant Mice Have Dysregulated Nuclear Maintenance, Cell Proliferation, and Motility Associated with Abnormal Glomerular Repair

2024· article· en· W4403835216 sur OpenAlexaff
Joanna Cunanan, Jasmeet Kaur Benepal, V Gregorio, Samantha Ricardo, Emine Bilge Çaparali, Ana Konvalinka, Moumita Barua

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRenal and related cancers
Établissements canadiensToronto General HospitalUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMotilityMutantCell biologyCell growthCancer researchBiologyInternal medicineEndocrinologyMedicineGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Focal segmental glomerulosclerosis (FSGS) is characterized by podocyte loss. Parietal epithelial cells (PECs) that express PAX2, a regulator of cellular and morphological changes during glomerular development, can regenerate podocytes after injury. We previously found that pathogenic PAX2 missense variants account for 4% of adult FSGS, and mutant PAX2+ PECs display impaired podocyte regeneration resulting in worsened FSGS in mice with a Pax2 missense variant (Pax2-MV) (Figure 1A-B). In this study, we report the molecular mechanisms of impaired podocyte regeneration in Pax2-MV. Methods: FSGS was induced by Adriamycin (ADR) in Pax2-MV and wildtype mice. Isolated glomeruli were subjected to mass spectrometry-based proteomics and analyzed by Gene Ontology (GO) and Reactome pathway enrichment analysis. Results: Downregulated processes in ADR-injured Pax2-MV compared to wildtype glomeruli include decreased metabolic processes and actin cytoskeleton structure regulation (Figure 1C), consistent with worsened podocyte loss observed in these mice. Upregulated processes in ADR-injured Pax2-MV include those involved in nuclear abnormalities, cell proliferation and motility (Figure 1D). These are consistent with the increased glomerular tuft cell proliferation observed in ADR-injured Pax2-MV mice. This suggests a maladaptive attempt to regenerate podocytes due to the lack of regeneration from mutant PAX2+ PECs. Conclusion: In ADR-injured Pax2-MV, downregulated metabolism and cytoskeleton structure are typical signatures of podocyte loss. However, our novel findings are the upregulated pathways that are consistent with dysregulated PAX2 signaling, including nuclear abnormalities, cell proliferation and motility. Funding: Government Support – Non-U.S.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,022

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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