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Enregistrement W4403841106 · doi:10.3390/microorganisms12112152

Coxsackievirus B3-Induced m6A Modification of RNA Enhances Viral Replication via Suppression of YTHDF-Mediated Stress Granule Formation

2024· article· en· W4403841106 sur OpenAlexafffund
Guangze Zhao, Huifang M. Zhang, Yankuan T. Chen, Sana Aghakeshmiri, Fione Yip, Honglin Luo, Bruce M. McManus, Decheng Yang

Notice bibliographique

RevueMicroorganisms · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensSt. Paul's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of Science and Technology of China
Mots-clésStress granuleGranule (geology)CoxsackievirusCell biologyReplication (statistics)RNAViral replicationChemistryVirologyBiologyVirusEnterovirusGeneMessenger RNABiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

N6-methyladenosine (m6A) is the most prevalent internal RNA modification. Here, we demonstrate that coxsackievirus B3 (CVB3), a common causative agent of viral myocarditis, induces m6A modification primarily at the stop codon and 3′ untranslated regions of its genome. As a positive-sense single-stranded RNA virus, CVB3 replicates exclusively in the cytoplasm through a cap-independent translation initiation mechanism. Our study shows that CVB3 modulates the expression and nucleo-cytoplasmic transport of the m6A machinery components—METTL3, ALKBH5 and YTHDFs—resulting in increased m6A modifications that enhance viral replication. Mechanistically, this enhancement is mediated through YTHDF-driven stress granule (SG) formation. We observed that YTHDF proteins co-localize with human antigen R (HuR), a protein facilitating cap-independent translation, in SGs during early infection. Later in infection, YTHDFs are cleaved, suppressing SG formation. Notably, for the first time, we identified that during early infection CVB3’s RNA-dependent RNA polymerase (3D) and double-stranded RNA (dsRNA) are stored in SGs, co-localizing with HuR. This early-stage sequestration likely protects viral components for use in late-phase replication, when SGs are disrupted due to YTHDF cleavage. In summary, our findings reveal that CVB3-induced m6A modifications enhance viral replication by regulating YTHDF-mediated SG dynamics. This study provides a potential therapeutic strategy for CVB3-induced myocarditis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Étiquettes directes de modèles (non validées)

Étiquettes de catégorie et de devis d'étude par modèle, issues des rondes d'étiquetage. C'est une sortie machine, non validée, et le désaccord entre modèles est livré comme donnée. Aucun devis ici n'est encore validé contre MEDLINE.

BrasCatégoriesDevis d'étudeConfiance
gemmaaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Expérimental (laboratoire)low
gptaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Expérimental (laboratoire)high
modèles en accordL'accord compare des ensembles de catégories et des devis identiques entre les bras.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,485

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Étiqueté directement par 2 modèles lisant le dossier complet.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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