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Enregistrement W4403851941 · doi:10.1038/s41375-024-02400-w

Comparative small molecule screening of primary human acute leukemias, engineered human leukemia and leukemia cell lines

2024· article· en· W4403851941 sur OpenAlexafffund
Safia Safa-Tahar-Henni, Karen L. Martinez, Verena Gress, Nayeli Esparza, Élodie Roques, Florence Bonnet‐Magnaval, Mélanie Bilodeau, Valérie Gagné, Eva Bresson, Sophie Cardin, Nehmé El-Hachem, Isabella Iasenza, Gabriel Alzial, Isabel Boivin, Naoto Nakamichi, Anne-Cécile Soufflet, Cristina Mirela Pascariu, Jean Duchaine, Simon Mathien, Éric Bonneil, Kolja Eppert, Anne Marinier, Guy Sauvageau, Geneviève Deblois, Pierre Thibault, Josée Hébert, Connie J. Eaves, Sonia Cellot, Frédéric Barabé, Brian T. Wilhelm

Notice bibliographique

RevueLeukemia · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensUniversité LavalHôpital Maisonneuve-RosemontUniversité de MontréalUniversity of British ColumbiaCentre hospitalier de l'Université LavalDiscovery CentreMcGill UniversityMcGill University Health CentreInstitute for Research in Immunology and CancerBC Cancer AgencyCentre hospitalier universitaire de QuébecIONICS Mass Spectrometry (Canada)Centre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesCIHR Skin Research Training CentreFonds de Recherche du Québec - SantéCHU Sainte-Justine FoundationCancer Research SocietyTerry Fox Research InstituteUniversité de MontréalCanadian Cancer Society Research InstituteTerry Fox FoundationNational Institutes of HealthChildren's Hospital FoundationGovernment of CanadaNational Cancer InstituteMolson FoundationCanadian Institutes of Health ResearchJW and HM Goodman Family Foundation
Mots-clésLeukemiaHuman cellPrimary (astronomy)Cancer researchMedicineCell cultureBiologyImmunologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Targeted therapeutics for high-risk cancers remain an unmet medical need. Here we report the results of a large-scale screen of over 11,000 molecules for their ability to inhibit the survival and growth in vitro of human leukemic cells from multiple sources including patient samples, de novo generated human leukemia models, and established human leukemic cell lines. The responses of cells from de novo models were most similar to those of patient samples, both of which showed striking differences from the cell-line responses. Analysis of differences in subtype-specific therapeutic vulnerabilities made possible by the scale of this screen enabled the identification of new specific modulators of apoptosis, while also highlighting the complex polypharmacology of anti-leukemic small molecules such as shikonin. These findings introduce a new platform for uncovering new therapeutic options for high-risk human leukemia, in addition to reinforcing the importance of the test sample choice for effective drug discovery.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,075
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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