PilY1 regulates the dynamic architecture of the type IV pilus machine in Pseudomonas aeruginosa
Notice bibliographique
Résumé
Type IV pili (T4P) produced by the pathogen Pseudomonas aeruginosa play a pivotal role in adhesion, surface motility, biofilm formation, and infection in humans. Despite the significance of T4P as a potential therapeutic target, key details of their dynamic assembly and underlying molecular mechanisms of pilus extension and retraction remain elusive, primarily due to challenges in isolating intact T4P machines from the bacterial cell envelope. Here, we combine cryo-electron tomography with subtomogram averaging and integrative modelling to resolve in-situ architectural details of the dynamic T4P machine in P. aeruginosa cells. The T4P machine forms 7-fold symmetric cage-like structures anchored in the cell envelope, providing a molecular framework for the rapid exchange of major pilin subunits during pilus extension and retraction. Our data suggest that the T4P adhesin PilY1 forms a champagne-cork-shaped structure, effectively blocking the secretin channel in the outer membrane whereas the minor-pilin complex in the periplasm appears to contact PilY1 via the central pore of the secretin gate. These findings point to a hypothetical model where the interplay between the secretin protein PilQ and the PilY1-minor-pilin priming complex is important for optimizing conformations of the T4P machine in P. aeruginosa, suggesting a gate-keeping mechanism that regulates pilus dynamics.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».