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Enregistrement W4403894249 · doi:10.1186/s13007-024-01289-x

Optimization of a rapid, sensitive, and high throughput molecular sensor to measure canola protoplast respiratory metabolism as a means of screening nanomaterial cytotoxicity

2024· article· en· W4403894249 sur OpenAlexafffund
Zhila Osmani, Muhammad Amirul Islam, Feng Wang, Sabrina Rodrigues Meira, Marianna Kulka

Notice bibliographique

RevuePlant Methods · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensNational Institute for NanotechnologyUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Research Council CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaSaskatchewan Canola Development CommissionWestern Grains Research Foundation
Mots-clésResazurinProtoplastCytotoxicitySulforhodamine BChemistryToxicityViability assayChromatographyBiochemistryIn vitroOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nanomaterial-mediated plant genetic engineering holds promise for developing new crop cultivars but can be hindered by nanomaterial toxicity to protoplasts. We present a fast, high-throughput method for assessing protoplast viability using resazurin, a non-toxic dye converted to highly fluorescent resorufin during respiration. Protoplasts isolated from hypocotyl canola (Brassica napus L.) were evaluated at varying temperatures (4, 10, 20, 30 ˚C) and time intervals (1-24 h). Optimal conditions for detecting protoplast viability were identified as 20,000 cells incubated with 40 µM resazurin at room temperature for 3 h. The assay was applied to evaluate the cytotoxicity of silver nanospheres, silica nanospheres, cholesteryl-butyrate nanoemulsion, and lipid nanoparticles. The cholesteryl-butyrate nanoemulsion and lipid nanoparticles exhibited toxicity across all tested concentrations (5-500 ng/ml), except at 5 ng/ml. Silver nanospheres were toxic across all tested concentrations (5-500 ng/ml) and sizes (20-100 nm), except for the larger size (100 nm) at 5 ng/ml. Silica nanospheres showed no toxicity at 5 ng/ml across all tested sizes (12-230 nm). Our results highlight that nanoparticle size and concentration significantly impact protoplast toxicity. Overall, the results showed that the resazurin assay is a precise, rapid, and scalable tool for screening nanomaterial cytotoxicity, enabling more accurate evaluations before using nanomaterials in genetic engineering.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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