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Enregistrement W4403917403 · doi:10.3390/jof10110749

The Influence of Aspergillus fumigatus Fatty Acid Oxygenases PpoA and PpoC on Caspofungin Susceptibility

2024· article· en· W4403917403 sur OpenAlexfundno aff
Endrews Delbaje, Patrícia Alves de Castro, Dante G. Calise, Mengyao Niu, Maria Augusta Crivelente Horta, Daniel Yuri Akiyama, João Guilherme de Moraes Pontes, Taícia Pacheco Fill, Olaf Kniemeyer, Thomas Krüger, Axel A. Brakhage, Koon Ho Wong, Nancy P. Keller, Gustavo H. Goldman

Notice bibliographique

RevueJournal of Fungi · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycotoxins in Agriculture and Food
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthAzrieli FoundationConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoInternational Development Research CentreFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloCanadian Institutes of Health ResearchCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Mots-clésAspergillus fumigatusCaspofunginOxygenaseChemistryAspergillusFungi imperfectiMicrobiologyBiologyBiochemistryGeneAntifungal

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aspergillus fumigatus can cause invasive pulmonary aspergillosis (IPA). Fungicidal azoles and fungistatic caspofungin (CAS) are the first- and second-line therapies, respectively, used to treat IPA. Treatment of A. fumigatus with CAS or micafungin induces the production of the oxylipin 5,8-diHODE by the fungal oxygenase PpoA. For this article, we investigated the influence of ppo genes, which encode the fatty acid oxygenases responsible for oxylipin biosynthesis, on CAS tolerance. The influence of PpoA and PpoC on CAS tolerance is mediated by MpkA phosphorylation and protein kinase A (PKA) activity. RNAseq transcriptional profiling and the label-free quantitative proteomics of the ppoA and ppoC mutants showed that differentially expressed genes and proteins are related to secondary metabolites and carbohydrate metabolism. We also characterized two clinical isolates, CM7555 and IFM61407, which decrease and increase susceptibility to CAS, respectively. CM7555 does not exhibit increased oxylipin production in the presence of CAS but oxylipin induction upon CAS exposure is increased in IFM61407, suggesting that oxylipins are not the only mechanism involved in CAS tolerance in these isolates. Upon CAS exposure, CM7555 has higher MpkA phosphorylation and PKA activity than IFM61407. Our results reveal the different aspects and genetic determinants involved in A. fumigatus CAS tolerance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,795
Score d'incertitude au seuil0,133

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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