CRISPR/Cas9 screening reveals Zfp607b as a novel transcription factor regulating myogenesis
Notice bibliographique
Résumé
CRISPR/Cas9 screening reveals Zfp607b as a novel transcription factor regulating myogenesis Skeletal muscle formation (myogenesis) is a complex process, and transcription factors (TFs) play an important role in controlling the phases of developmental myogenesis, particularly in myoblast proliferation and differentiation. 1 However, the functions of numerous TFs in myoblast development and myogenesis remain unclear.To systematically identify TFs regulating myogenesis in skeletal muscle, we performed a genome-scale CRISPR-Cas9 loss-offunction (LOF) screen in mouse myoblast cells to identify TFs whose loss contributes to skeletal muscle proliferation.After screening, we identified 855 TFs closely associated with C2C12 cell proliferation.Functionally, we validated that Zfp607b improved skeletal muscle differentiation and regeneration using RNA interference knockdown in vitro and lentiviral injection in vivo.For the top fold-change genes in the TF knockout cell library, we explored potential mechanisms using transcriptomics and immunofluorescence.In conclusion, we constructed a genome-wide TF knockout cell library in myoblast and identified a novel TF, Zfp607b, that significantly participated in myogenesis and skeletal muscle regeneration.Our findings contribute to the understanding of the ZFP family involved in myogenesis and regeneration and provide a platform for studying the biological function of TFs in the future.Furthermore, our study offers valuable resources for understanding skeletal muscle development and human muscle-related diseases.In this study, we successfully established a monoclonal C2C12-Cas9 cell line and identified the CRISPR efficiency using Western blot, indirect immunofluorescence assay, and gene editing sequencing.Cas9 proteins were detected via Western blot (Fig. S1A), and the results of indirect immunofluorescence assay showed Cas9 proteins expressed in the cytoplasm of C2C12-Cas9 monoclonal cells, indicated by
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».