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Enregistrement W4404035252 · doi:10.1101/2024.11.01.24316601

A confounder debiasing method for RCT-like comparability enables Machine Learning-based personalization of survival benefit in living donor liver transplantation

2024· preprint· en· W4404035252 sur OpenAlexaff
Anirudh Gangadhar, Bima J. Hasjim, Xun Zhao, Yingji Sun, Joseph Chon, Aman Sidhu, Elmar Jaeckel, Nazia Selzner, Mark S. Cattral, Blayne A. Sayed, Michael Brudno, Chris McIntosh, Mamatha Bhat

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOrgan Transplantation Techniques and Outcomes
Établissements canadiensVector InstitutePrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health NetworkToronto General HospitalUniversity of TorontoMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDebiasingComparabilityRandomized controlled trialPersonalizationConfoundingLiving donor liver transplantationMedicineTransplantationComputer scienceLiver transplantationSurgeryPsychologyInternal medicineWorld Wide WebMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Many clinical questions in medicine cannot be answered through randomized controlled trials (RCTs) due to ethical or feasibility constraints. In such cases, observational data is often the only available resource for evaluating treatment effects. To address this challenge, we have developed Decision Path Similarity Matching (DPSM), a novel machine learning (ML)-based algorithm that simulates RCT-like conditions to debias observational data. In this study, we apply DPSM to the clinical question of living donor liver transplantation (LDLT) versus deceased donor liver transplantation (DDLT), helping to identify which patients benefit most from LDLT. DPSM leverages decision paths from a Random Forest classifier to perform accurate, one-to-one matching between LDLT and DDLT recipients, minimizing confounding while retaining interpretability. Using data from the Scientific Registry of Transplant Recipients (SRTR), including 4,473 LDLT and 68,108 DDLT patients transplanted between 2002 and 2023, we trained independent Random Survival Forest (RSF) models on the matched cohorts to predict post-transplant survival. DPSM successfully reduced confounding associations between the two groups as shown by a decrease in area under the receiver operating characteristic (AUROC) from 0.82 to 0.51. Subsequently, RSF (C-index ldlt =0.67, C-index ddlt =0.74) outperformed the traditional Cox model (C-index ldlt =0.57, C-index ddlt =0.65). The predicted 10-year mean survival gain was 10.3% (SD = 5.7%). In conclusion, DPSM provides an effective approach for creating RCT-like comparability from observational data, enabling personalized survival predictions. By leveraging real-world data where RCTs are impractical, this method offers clinicians a tool for transitioning from population-level evidence to more nuanced, personalization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,153
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,372
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,153
Score d'incertitude au seuil0,811

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1530,372
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,003
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,003
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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Résumé présentoui

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