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Enregistrement W4404112357 · doi:10.1002/anie.202412786

Thieno[3,2‐<i>b</i>]pyridine: Attractive scaffold for highly selective inhibitors of underexplored protein kinases with variable binding mode

2024· article· en· W4404112357 sur OpenAlexfundno aff
Paula Martín Moyano, Tadeáš Kubina, Štěpán Owen Paruch, Aneta Jarošková, Jan Novotný, Veronika Skočková, Petra Ovesná, Tereza Suchánková, Polina Prokofeva, Bernhard Küster, Michal Šmída, A. Chaikuad, Andreas Krämer, Stefan Knapp, Karel Souček, Kamil Paruch

Notice bibliographique

RevueAngewandte Chemie International Edition · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Degradation and Inhibitors
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesHORIZON EUROPE Framework ProgrammeDeutschen Konsortium für Translationale KrebsforschungMasarykova UniverzitaMinisterstvo Zdravotnictví Ceské RepublikyGrantová Agentura České RepublikyEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsGenome CanadaMcGill UniversityMinisterstvo Školství, Mládeže a TělovýchovyBayerEuropean CommissionGenentechDeutsche KrebshilfeBader PhilanthropiesPfizerDeutsches KrebsforschungszentrumBristol-Myers Squibb
Mots-clésKinomePharmacophoreKinaseChemistryContext (archaeology)Protein kinase AScaffold proteinBiochemistryStereochemistryBiologySignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Protein kinases are key regulators of numerous biological processes and aberrant kinase activity can cause various diseases, particularly cancer. Herein, we report the identification of new series of highly selective kinase inhibitors based on the thieno[3,2-b]pyridine scaffold. The weak interaction of the thieno[3,2-b]pyridine core with the kinase hinge region allows for profoundly different binding modes all of which maintain high kinome-wide selectivity, as illustrated by the isomers MU1464 and MU1668. Thus, this core structure provides a template of ATP-competitive but not ATP-mimetic inhibitors that are anchored at the kinase back pocket. Mapping the chemical space around the central thieno[3,2-b]pyridine pharmacophore afforded highly selective inhibitors of the kinase Haspin, exemplified by the compound MU1920 that fulfils criteria for a quality chemical probe and is suitable for use in in vivo applications. However, despite the role of Haspin in mitosis, the inhibition of Haspin alone was not sufficient to elicit cytotoxic effect in cancer cells. The thieno[3,2-b]pyridine scaffold can be used in a broader context, as a basis of inhibitors targeting other underexplored protein kinases, such as CDKLs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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