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Enregistrement W4404169970 · doi:10.1101/2024.11.08.24316708

Observational Report on Functional SARS-CoV-2 Immune Responses in Immune Competent and Compromised Individuals

2024· preprint· en· W4404169970 sur OpenAlexaff
Laura J. Peek, Alicia L. Patrick, Niki Givens, Brittany D’Alessio, Amanda Weaver, Leisa Jackson, Thomas J. White, Gary A. Pestano

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensDillon Consulting
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmune systemObservational studySevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)VirologyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)ImmunologyMedicineBiologyInternal medicineInfectious disease (medical specialty)Disease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Objectives Durable immune responses against SARS-CoV-2 are generally observed in previously infected individuals. Immunocompromised individuals may show less durable responses. Investigation of immune responses is needed to inform individuals on whether measures such as boosters may be advisable. Methods Three SARS-CoV-2 ELISA tests were utilized to monitor responses in 82 individuals in the United States [nucleocapsid protein (N)-specific antibody and spike RBD (receptor binding domain)-specific neutralizing antibody (nAb), and spike-specific interferon-γ (IFN-γ) release by T cells]. De-identified case reports highlight results for this cohort; 21 previously infected and vaccinated, 57 never infected and vaccinated, 2 breakthrough infections post-vaccination and 2 neither infected nor vaccinated. Results The vaccines generated nAb responses in naïve donors, and in previously infected individuals with waning responses, immunosuppression, or weak infection responses. The cutoff for the nAb potency was established at 41.1 IU/mL when calibrated to the WHO International Standard (IU) using the NCI SARS-CoV-2 Standard. This relationship has the critical potential to allow comparisons of nAb measures to be utilized in studies of correlates of protection. Further, previously infected donors demonstrated robust T cell activity, while vaccinated and infection-naïve individuals had lower responses. Conclusions Calibrated ELISA tests may aid broad vaccination strategies given their low cost and wide accessibility. Additional studies that relate measures of the adaptive responses to immunity from serious disease and infection are needed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,143
Tête enseignante GPT0,380
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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