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Enregistrement W4404186637 · doi:10.1016/j.lwt.2024.117028

Characterization and genome analysis of two Aeromonas phages isolated from various sources related to chilled chicken

2024· article· en· W4404186637 sur OpenAlexaff
Haijing Hu, Linlin Cai, Liangting Shao, Xinglian Xu, Huhu Wang, Guanghong Zhou

Notice bibliographique

RevueLWT · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensMinistry of Education and Child Care
Organismes subventionnairesNatural Science Foundation of Jiangsu ProvinceNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésAeromonasGenomeBiologyMicrobiologyComputational biologyGeneticsGeneBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aeromonas is a primary spoilage bacterium found in chilled meat and serves as a significant pathogenic and spoilage agent in fish culture. Bacteriophages present a viable alternative to antibiotics for the targeted elimination of Aeromonas , minimizing environmental stress. In this study, two Aeromonas phages, P36 and P40, were isolated from samples collected in the slaughtering environment and from chilled chicken products. Both P36 and P40 exhibit the identical host range. They have optimal multiplicities of infection (MOI) of 0.001, with lysis times of 120 minutes and 180 minutes, respectively. These phages demonstrate stable survival within a temperature range of 4-40°C and a pH range of 5-11. Morphological and genomic analyses indicate that the two Aeromonas phages belong to the order Caudovirales , family Podoviridae , subfamily Autographivirinae . The genomes of the two phages were composed of linear double-stranded DNA (dsDNA) with lengths of 41,454 bp and 41,484 bp, respectively. Notably, there were no coding genes associated with safety factors such as virulence, antibiotic resistance, or lysogenicity present in the genomes. This finding indicates that the two phages possess potential applications in food safety and therapeutic contexts. • Two Aeromonas phages were isolated from slaughterhouses and chilled chickens. • Two lytic phages are classified in family Podoviridae , subfamily Autographivirinae. • Their genomes do not contain any known coding genes that present safety concerns.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,973
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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