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Enregistrement W4404230728 · doi:10.1093/neuonc/noae165.0955

EXTH-24. THERAPEUTIC TARGETING OF MISLOCALIZED NUCLEAR ENVELOPE PROTEINS IN<i>MYC</i>-DRIVEN GROUP 3 MEDULLOBLASTOMA

2024· article· en· W4404230728 sur OpenAlexaff
Yujin Suk, Jorge Ibañez-Vega, Iqra Chaudhry, Martín A. Rossotti, Minomi Subapanditha, Petar Miletic, Stefan Custers, Laura Escudero, Alberto Delaidelli, Takuma Nakashima, Yuxi Xiao, Jason Moffat, Hiromichi Suzuki, Poul H. Sorensen, Kevin A. Henry, Chitra Venugopal, Giedre Krenciute, Sheila K. Singh

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrotubule and mitosis dynamics
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaNational Research Council CanadaUniversity of TorontoMcMaster UniversityHamilton Health Sciences
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedulloblastomaEnvelope (radar)Group (periodic table)Cancer researchNeuroscienceBiologyChemistryComputer scienceTelecommunications

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Medulloblastoma (MB) is the most common, malignant pediatric brain tumour comprised of four distinct molecular subgroups (WNT, SHH, Group 3, and Group 4). A subset of Group 3 MB tumors harbors focal amplifications of the MYC oncogene (MYC-G3MB) and are particularly prone to tumour recurrence due to their highly proliferative nature linked to its embryonic stem cell-of-origin and programming. We discovered that LBR, an inner nuclear transmembrane protein, while present in all cells at the nuclear envelope (NE), is aberrantly presented to the cell surface in MYC-G3MBs. Transcriptomic profiling of publicly available datasets identified significant NE protein enrichment in MYC-G3MB compared to normal tissue and high expression during fetal development that dampens postnatally and in adult samples. Immunohistochemistry analysis of LBR on patient tumors was able to significantly prognosticate overall and progression free survival. Flow cytometry analysis identified LBR cell surface expression in MYC-G3MBs with low to no expression in human neural stem cells and other MB subgroups. High resolution microscopy of endogenously tagged LBR revealed cell surface presentation to be linked to ER-like vesicles that directly trafficked to the cell surface in MYC-G3MBs. Transcriptomic analysis of LBR cell surface positive and negative cells identified LBR to be linked to mitotic processes and mislocalization was significantly enriched following exposure to chemotherapy and radiation in vitro and in vivo. Therefore, we demonstrate that LBR is an ideal therapeutic target for patients facing treatment-refractory MB and have generated single domain antibodies (sdAb) to develop LBR-CAR T cells. Validation of LBR sdAbs demonstrate on-target binding and comparable affinity and avidity to commercial LBR antibodies. There is an undeniable paucity of targets for MB patients stemming from the lack of neoantigens and genomic aberrations in pediatric tumors. The preclinical development and validation of novel immunotherapeutic targets such as LBR provides alternative therapies for patients otherwise facing palliation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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