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Enregistrement W4404286134 · doi:10.1039/d4sc05459h

Rapid, potent, and persistent covalent chemical probes to deconvolute PI3Kα signaling

2024· article· en· W4404286134 sur OpenAlexafffund
Lukas Bissegger, Theodora A. Constantin, Erhan Keleş, Luka Raguž, Isobel Barlow-Busch, Clara Orbegozo, Thorsten Schaefer, Valentina Borlandelli, Thomas Bohnacker, Rohitha Sriramaratnam, Alexander Schäfer, Matthias Gstaiger, John E. Burke, Chiara Borsari, Matthias P. Wymann

Notice bibliographique

RevueChemical Science · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePI3K/AKT/mTOR signaling in cancer
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesGovernment of SaskatchewanCanadian Institutes of Health ResearchNational Science FoundationInnosuisse - Schweizerische Agentur für InnovationsförderungMichael Smith Health Research BCEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsCancer Research SocietySchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungMcGill UniversityNovartis FoundationUniversity of SaskatchewanNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaPeter und Traudl Engelhorn StiftungCanadian Light SourceKrebsliga Schweiz
Mots-clésCovalent bondChemistryPI3K/AKT/mTOR pathwayPharmacologyComputational biologySignal transductionBiochemistryMedicineOrganic chemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

protein kinase B (PKB/Akt) and forkhead box O (FOXO) revealed blunted pathway activity in cancer cell lines with constitutively activated PI3Kα lasting for several days. In contrast, persistent PI3Kα inhibition was rapidly bypassed by other class I PI3K isoforms in cells lacking functional phosphatase and tensin homolog (PTEN). Comparing the rapidly-diffusing, fast target-engaging chemical probe 9 to clinical reversible PI3Kα-selective inhibitors alpelisib, inavolisib and 9r, a reversible analogue of 9, revealed 9's superior potency to inhibit growth (up to 600-fold) associated with sustained suppression of PI3Kα signaling in breast cancer cell lines. Finally, using a simple washout protocol, the utility of the highly-selective covalent PI3Kα probe 9 was demonstrated by the quantification of the coupling of insulin, EGF and CXCL12 receptors to distinct PI3K isoforms for signal transduction in response to ligand-dependent activation. Collectively, these findings along with the novel covalent chemical probes against PI3Kα provide insights into isoform-specific functions in cancer cells and highlight opportunities to achieve improved selectivity and long-lasting efficacy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,636

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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