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Enregistrement W4404395566 · doi:10.1158/1078-0432.ccr-24-2983

Divergent Clinical and Immunologic Outcomes Based on <i>STK11</i> Co-mutation Status in Resectable <i>KRAS-</i> Mutant Lung Cancers Following Neoadjuvant Immune Checkpoint Blockade

2024· article· en· W4404395566 sur OpenAlexaff
Samuel Rosner, Sydney Connor, Khaled Sanber, Marianna Zahurak, Tianbei Zhang, Isha Gurumurthy, Zhen Zeng, Brad Presson, Dipika Singh, Roni Rayes, Lavanya Sivapalan, Gavin Pereira, Zhicheng Ji, Rohit Thummalapalli, Joshua E. Reuss, Stephen Broderick, David R. Jones, Julie S. Deutsch, Tricia R. Cottrell, Jamie E. Chaft, Jonathan Spicer, Janis M. Taube, Valsamo Anagnostou, Julie R. Brahmer, Drew M. Pardoll, Hongkai Ji, Patrick M. Forde, Kristen A. Marrone, Kellie N. Smith

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Immunotherapy and Biomarkers
Établissements canadiensQueen's UniversityMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesBloomberg~Kimmel Institute for Cancer Immunotherapy, Sidney Kimmel Comprehensive Cancer Center, Johns Hopkins UniversitySwim Across AmericaAmerican Lung AssociationMark Foundation For Cancer ResearchBristol-Myers SquibbLUNGevity FoundationNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthConquer Cancer Foundation
Mots-clésKRASImmune checkpointMedicineLung cancerCancer researchOncologyContext (archaeology)CancerImmunotherapyNeoadjuvant therapyInternal medicineSTK11BiologyColorectal cancerBreast cancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Co-mutations of the Kirsten rat sarcoma virus (KRAS) and serine/threonine kinase 11 (STK11) genes in advanced non-small cell lung cancer (NSCLC) are associated with immune checkpoint blockade (ICB) resistance. Although neoadjuvant chemoimmunotherapy is now a standard-of-care treatment for resectable NSCLC, the clinical and immunologic impacts of KRAS and STK11 co-mutations in this setting are unknown. EXPERIMENTAL DESIGN: We evaluated and compared recurrence-free survival of resectable KRAS-mutated NSCLC tumors, with or without co-occurring STK11 mutations, treated with neoadjuvant ICB. Single-cell transcriptomics was performed on tumor-infiltrating T cells from seven KRASmut/STK11wt tumors and six KRAS and STK11 co-mutated (KRASmut/STK11mut) tumors. RESULTS: Relative to KRASmut/STK11wt tumors, KRASmut/STK11mut exhibited significantly higher recurrence risk. Single-cell transcriptomics showed enhanced oxidative phosphorylation with evidence of decreased prostaglandin E2 signaling and increased IL-2 signaling in CD8+ tumor-infiltrating lymphocytes (TIL) from KRASmut/STK11mut tumors, a finding that was mirrored in KRASwt tumors that relapsed. TILs from KRASmut/STK11mut tumors expressed high levels of molecules associated with tumor residence, including CD39 and ZNF683 (HOBIT). CONCLUSIONS: These divergent T-cell transcriptional fates suggest that T-cell maintenance and residence may be detrimental to antitumor immunity in the context of neoadjuvant ICB for resectable NSCLC, regardless of KRAS mutation status. Our work provides a basis for future investigations into the mechanisms underpinning prostaglandin E2 signaling and IL-2 signaling as they relate to T-cell immunity to cancer and to divergent clinical outcomes in KRASmut/STK11mut NSCLC treated with neoadjuvant ICB.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,129
Tête enseignante GPT0,507
Écart entre enseignants0,377 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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