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Enregistrement W4404408980 · doi:10.1088/2515-7647/ad936b

Multispectral multiplexed confocal FLIM for live cell imaging

2024· article· en· W4404408980 sur OpenAlexafffund
Morgan Richards, Elizabeth J. Osterlund, Andrea Rhikkaella Buendia, Nikolina Malic, Ray Truant, Qiyin Fang

Notice bibliographique

RevueJournal of Physics Photonics · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced Fluorescence Microscopy Techniques
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMitacsCanada Foundation for Innovation
Mots-clésMultispectral imageSpectral imagingFluorescence-lifetime imaging microscopyConfocalPhotobleachingOpticsSpectral bandsImaging spectrometerFull spectral imagingHyperspectral imagingFrame rateSpectrometerMaterials sciencePhysicsFluorescenceRemote sensingGeology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Spectrally resolved fluorescence lifetime imaging (FLIM) with high spatial precision offers comprehensive information on species localization and behavior. It is challenging to resolve weak fluorescence signals in multiple dimensions (spatial, spectral, and temporal) at high frame rates, especially in dynamic live cell processes, as photobleaching and phototoxicity limit acceptable photon count rates. We developed a multiplexed confocal FLIM technique, which uses a prism-based imaging spectrometer to separate a 10 × 10 array of confocal foci into their spectral components. This allows the sampling of the spectra by a time-resolved image sensor to produce a multispectral time-resolved data set used for generating multispectral lifetime images. This system captures 300 × 300 pixel FLIM containing 12 unique spectral bands covering a 450–700 nm spectral range in 1.8 s of exposure. Its performance was demonstrated in fixed stained samples and in multispectral imaging of FLIM-FRET in live cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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