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Enregistrement W4404498748 · doi:10.1002/cam4.70401

A Combinatorial Functional Precision Medicine Platform for Rapid Therapeutic Response Prediction in <scp>AML</scp>

2024· article· en· W4404498748 sur OpenAlexfundno aff
Noor Rashidha Binte Meera Sahib, Jameelah Sheik Mohamed, Masturah Bte Mohd Abdul Rashid, Yihao Clement Lin, Yen Lin Chee, Bingwen Eugene Fan, Sanjay De Mel, Melissa Ooi, Wei‐Ying Jen, Edward Kai‐Hua Chow

Notice bibliographique

RevueCancer Medicine · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Medical Research CouncilMedical Research CouncilCancer Science Institute of Singapore, National University of SingaporeNetworks of Centres of Excellence of CanadaNational University of Singapore
Mots-clésMedicinePrecision medicineOncologyBiomarkerCombination therapyClinical trialDrug resistanceInternal medicineDrug developmentDrugPharmacologyPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Despite advances made in targeted biomarker-based therapy for acute myeloid leukemia (AML) treatment, remission is often short and followed by relapse and acquired resistance. Functional precision medicine (FPM) efforts have been shown to improve therapy selection guidance by incorporating comprehensive biological data to tailor individual treatment. However, effectively managing complex biological data, while also ensuring rapid conversion of actionable insights into clinical utility remains challenging. METHODS: We have evaluated the clinical applicability of quadratic phenotypic optimization platform (QPOP), to predict clinical response to combination therapies in AML and reveal patient-centric insights into combination therapy sensitivities. In this prospective study, 51 primary samples from newly diagnosed (ND) or refractory/relapsed (R/R) AML patients were evaluated by QPOP following ex vivo drug testing. RESULTS: Individualized drug sensitivity reports were generated in 55/63 (87.3%) patient samples with a median turnaround time of 5 (4-10) days from sample collection to report generation. To evaluate clinical feasibility, QPOP-predicted response was compared to clinical treatment outcomes and indicated concordant results with 83.3% sensitivity and 90.9% specificity and an overall 86.2% accuracy. Serial QPOP analysis in a FLT3-mutant patient sample indicated decreased FLT3 inhibitor (FLT3i) sensitivity, which is concordant with increasing FLT3 allelic burden and drug resistance development. Forkhead box M1 (FOXM1)-AKT signaling was subsequently identified to contribute to resistance to FLT3i. CONCLUSION: Overall, this study demonstrates the feasibility of applying QPOP as a functional combinatorial precision medicine platform to predict therapeutic sensitivities in AML and provides the basis for prospective clinical trials evaluating ex vivo-guided combination therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,216
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,356
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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