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Enregistrement W4404527351 · doi:10.1073/pnas.2406239121

Small-molecule disruption of androgen receptor–dependent chromatin clusters

2024· article· en· W4404527351 sur OpenAlexaff
Sarah E. Kohrt, EK Novak, Subhashish Tapadar, Bocheng Wu, Jonathan D. Strope, Yaw Asante, Hyunmin Kim, Matthew S. Chang, D. Gurdak, Athar Khalil, Michael P. Rood, Eric D. Raftery, Diana A. Stavreva, Holly M. Nguyen, Lisha G. Brown, Maddy Ramser, Cody J. Peer, Warren M. Meyers, Nicholas Aboreden, Maharshi Chakraborty, Richard Sallari, Peter S. Nelson, Kathleen Kelly, Thomas G.W. Graham, Xavier Darzacq, William D. Figg, Adegboyega K. Oyelere, Eva Corey, Remi Adelaiye‐Ogala, Berkley E. Gryder

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthInstitute for Bioengineering and BiosciencesKaleida Health FoundationU.S. Department of DefenseGeorgia Institute of TechnologyCase Comprehensive Cancer Center, Case Western Reserve UniversityUniversity at BuffaloUniversity of WashingtonNational Cancer InstituteCase Western Reserve UniversityItä-Suomen YliopistoPerelman School of Medicine, University of PennsylvaniaUniversitat de BarcelonaUniversity of PennsylvaniaProstate Cancer FoundationSchool of Medicine, Case Western Reserve University
Mots-clésAndrogen receptorEnzalutamideChromatinEnhancerEpigenomeProstate cancerCancer researchBiologyChromatin immunoprecipitationPromoterCell biologyAndrogenGeneChemistryComputational biologyGene expressionCancerEndocrinologyGeneticsDNA methylationHormone

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sustained androgen receptor (AR) signaling during relapse is a central driver of metastatic castration-resistant prostate cancer (mCRPC). Current AR antagonists, such as enzalutamide, fail to provide long-term benefit for the mCRPC patients who have dramatic increases in AR expression. Here, we report AR antagonists with efficacy in AR-overexpressing models. These molecules bind to the ligand-binding domain of the AR, promote AR localization to the nucleus, yet potently and selectively down-regulate AR-target genes. The molecules BG-15a and the pharmacokinetically optimized BG-15n elicit a decrease in cell and tumor growth in vitro and in vivo in models of mCRPC. BG-15a/n treatment causes the collapse of chromatin loops between enhancers and promoters at key genes in the AR-driven epigenome. AR binding in the promoter, as well as 3D chromatin clustering, is needed for genes to respond. BG-15a/n represent promising agents for treating patients with relapsed AR-driven mCRPC tumors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,064
Tête enseignante GPT0,356
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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