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Enregistrement W4404565156 · doi:10.1016/j.ijmedinf.2024.105708

Developing a prototype for federated analysis to enhance privacy and enable trustworthy access to COVID-19 research data

2024· article· en· W4404565156 sur OpenAlexaff
Solmaz Eradat Oskoui, Matthew Retford, Eoghan Forde, Rodrigo Barnes, Karen J. Hunter, Anne Wozencraft, Simon Thompson, Chris Orton, David Ford, Sharon Heys, Julie Kennedy, Cynthia McNerney, Jeffrey Peng, Hamed Ghanbariadolat, Sarah Rees, Rachel Mulholland, Aziz Sheikh, David Burgner, Meredith Brockway, Meghan B. Azad, Natalie Rodriguez, Helga Zoëga, Sarah J. Stock, Clara Calvert, Jessica E. Miller, Nicole Fiorentino, Amy Racine, Jonas Häggström, Neil Postlethwaite

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Medical Informatics · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiquePrivacy-Preserving Technologies in Data
Établissements canadiensUniversity of ManitobaChildren's Hospital Research Institute of ManitobaAlberta Children's Hospital
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilMinderoo FoundationUniversity of New South WalesSwansea UniversityWellcome TrustBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésTrustworthinessComputer scienceInternet privacyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Information privacyComputer securityWorld Wide WebData scienceMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The use of federated networks can reduce the risk of disclosure for sensitive datasets by removing the requirement to physically transfer data. Federated networks support federated analytics, a type of privacy-enhancing technology, enabling trustworthy data analysis without the movement of source data. OBJECTIVES: To set out the methodology used by the International COVID-19 Data Alliance (ICODA) and its partners, the Secure Anonymised Information Linkage (SAIL) Databank and Aridhia Informatics in piloting a federated network infrastructure and consequently testing federated analytics using test data provided from an ICODA project, the International Perinatal Outcome in the Pandemic (iPOP) Study. To share the challenges and benefits of using a federated network infrastructure to enable trustworthy analysis of health-related data from multiple countries and sources. RESULTS: This project successfully developed a federated network between the SAIL Databank and the ICODA Workbench and piloted the use of federated analysis using aggregate-level model outputs as test data from the iPOP Study, a one-year, multi-country COVID-19 research project. This integration is a first step in implementing the necessary technical, governance and user experiences for future research studies to build upon, including those using individual-level datasets from multiple data nodes. CONCLUSIONS: Creating federated networks requires extensive investment from a data governance, technology, training, resources, timing and funding perspective. For future initiatives, the establishment of a federated network should be built into medium to long term plans to provide researchers with a secure and robust data analysis platform to perform joint multi-site collaboration. Federated networks can unlock the enormous potential of national and international health datasets through enabling collaborative research that addresses critical public health challenges, whilst maintaining privacy and trustworthiness by preventing direct access to the source data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,010
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,025
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Science ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Reproductibilité · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,996
Score d'incertitude au seuil0,053

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0100,025
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0050,008
Science ouverte0,0040,006
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,232
Tête enseignante GPT0,523
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
DomaineReproductibilité
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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