MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4404587345 · doi:10.7554/elife.96085.3

ACK1 and BRK non-receptor tyrosine kinase deficiencies are associated with familial systemic lupus and involved in efferocytosis

2024· article· en· W4404587345 sur OpenAlexaff
S. Guillet, Tomi Lazarov, Natasha Jordan, Bertrand Boisson, María Tello‐Lafoz, Barbara P. Craddock, Ting Zhou, Chihiro Nishi, Rohan Bareja, Hairu Yang, Frédéric Rieux‐Laucat, Rosa Fregel, Sabrina D. Dyall, David Isenberg, David D’Cruz, Nico Lachmann, Olivier Elemento, Agnès Viale, Nicholas D. Socci, Laurent Abel, Shigekazu Nagata, Morgan Huse, W. Todd Miller, Jean‐Laurent Casanova, Frédéric Geissmann

Notice bibliographique

RevueeLife · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePhagocytosis and Immune Regulation
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesCore Research for Evolutional Science and TechnologyNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesJapan Society for the Promotion of ScienceFondation pour la Recherche MédicaleAssistance Publique - Hôpitaux de ParisArthritis Research UK
Mots-clésEfferocytosisMERTKImmunologyTyrosine kinaseSystemic lupus erythematosusAutoantibodyAutoimmunityMedicineBiologyImmune systemCancer researchReceptor tyrosine kinaseMacrophageKinaseCell biologySignal transductionDiseaseAntibodyInternal medicineGeneticsIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Systemic lupus erythematosus (SLE) is an autoimmune disease, the pathophysiology and genetic basis of which are incompletely understood. Using a forward genetic screen in multiplex families with SLE, we identified an association between SLE and compound heterozygous deleterious variants in the non-receptor tyrosine kinases (NRTKs) ACK1 and BRK . Experimental blockade of ACK1 or BRK increased circulating autoantibodies in vivo in mice and exacerbated glomerular IgG deposits in an SLE mouse model. Mechanistically, NRTKs regulate activation, migration, and proliferation of immune cells. We found that the patients’ ACK1 and BRK variants impair efferocytosis, the MERTK-mediated anti-inflammatory response to apoptotic cells, in human induced pluripotent stem cell (hiPSC)-derived macrophages, which may contribute to SLE pathogenesis. Overall, our data suggest that ACK1 and BRK deficiencies are associated with human SLE and impair efferocytosis in macrophages.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueeLifeMême sujetPhagocytosis and Immune RegulationTravaux en français237 207