Alteration of the tumor suppressor PDCD4 in acute myeloid leukemias
Notice bibliographique
Résumé
PDCD4 est un suppresseur de tumeur impliqué dans le contrôle traductionnel. En effet, ce facteur est capable d'inhiber la traduction de certains ARNm via ses différents domaines fonctionnels. Sa partie N-terminale est composée d'un domaine de liaison à l'ARN qui altère la liaison des ribosomes et inhibe la traduction dépendante de la coiffe ou d'IRES. Le reste de la protéine est composé de domaines MA-3 liant et séquestrant le facteur d'initiation de la traduction eIF4A, inhibant ainsi la traduction dépendante de la coiffe. En tant que suppresseur de tumeur, PDCD4 est réprimé dans de nombreux cancers favorisant ainsi la prolifération des cellules cancéreuses. Or ce n'est pas le cas dans les Leucémies Aiguës Myéloïdes (LAM). Nous avons mis en évidence d'autres mécanismes impactant le facteur PDCD4 qui n'altèrent pas son niveau d'expression global. D'une part, nous avons identifié un nouveau variant d'épissage de l'ARNm de PDCD4 chez des patients atteints de LAM, dans lequel l'exon 2 est exclu. Cet ARNm code pour une protéine PDCD4 tronquée dont la traduction est initiée dans le 6ème exon et dont l'expression pourrait être faible du fait de la longueur du 5'UTR de son ARNm. D'autre part, nous avons mis en évidence la présence d'un clivage de la protéine PDCD4 dans les lignées cellulaires de LAM. Ce clivage est indépendant de l'action du protéasome et conduit également à l'expression d'une protéine tronquée. Ces deux formes protéiques de PDCD4 sont capables de lier le facteur d'initiation de la traduction eIF4A mais sont dépourvues de la partie N-terminale, soit du domaine de liaison à l'ARN. Ainsi, bien qu'elles soient en mesure de lier eIF4A, leur action sur la traduction est surement réduite. En effet, le domaine de liaison à l'ARN est essentiel pour une inhibition efficace de la traduction dépendante de la coiffe et dépendante d'IRES. Nous avons également détecté ces altérations de PDCD4 dans des cellules souches/progénitrices saines et observé leur diminution au cours de la différenciation myéloïde. Ces mécanismes maintenus dans les cellules cancéreuses permettent de réduire l'effet de PDCD4. Ces formes tronquées sont probablement moins actives en tant que suppresseur de tumeur et pourraient définir un nouveau sous-groupe de patients atteints de LAM pour lesquels PDCD4 ne serait pas pleinement actif.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».