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Record W4404656377

Alteration of the tumor suppressor PDCD4 in acute myeloid leukemias

2024· dissertation· en· W4404656377 on OpenAlexfundno aff
Eulalie Corre

Bibliographic record

VenueHAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe) · 2024
Typedissertation
Languageen
FieldMedicine
TopicAcute Myeloid Leukemia Research
Canadian institutionsnot available
FundersFondation Toulouse Cancer SantéRégion Occitanie Pyrénées-MéditerranéeSociété Française d'HématologieMinistère de l'Enseignement Supérieur et de la RechercheFondation pour la Recherche MédicaleInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleGenome Canada
KeywordsCancer researchSuppressorMyeloid leukemiaMedicineMyeloidMyeloid leukaemiaInternal medicineCancer
DOInot available

Abstract

fetched live from OpenAlex

PDCD4 est un suppresseur de tumeur impliqué dans le contrôle traductionnel. En effet, ce facteur est capable d'inhiber la traduction de certains ARNm via ses différents domaines fonctionnels. Sa partie N-terminale est composée d'un domaine de liaison à l'ARN qui altère la liaison des ribosomes et inhibe la traduction dépendante de la coiffe ou d'IRES. Le reste de la protéine est composé de domaines MA-3 liant et séquestrant le facteur d'initiation de la traduction eIF4A, inhibant ainsi la traduction dépendante de la coiffe. En tant que suppresseur de tumeur, PDCD4 est réprimé dans de nombreux cancers favorisant ainsi la prolifération des cellules cancéreuses. Or ce n'est pas le cas dans les Leucémies Aiguës Myéloïdes (LAM). Nous avons mis en évidence d'autres mécanismes impactant le facteur PDCD4 qui n'altèrent pas son niveau d'expression global. D'une part, nous avons identifié un nouveau variant d'épissage de l'ARNm de PDCD4 chez des patients atteints de LAM, dans lequel l'exon 2 est exclu. Cet ARNm code pour une protéine PDCD4 tronquée dont la traduction est initiée dans le 6ème exon et dont l'expression pourrait être faible du fait de la longueur du 5'UTR de son ARNm. D'autre part, nous avons mis en évidence la présence d'un clivage de la protéine PDCD4 dans les lignées cellulaires de LAM. Ce clivage est indépendant de l'action du protéasome et conduit également à l'expression d'une protéine tronquée. Ces deux formes protéiques de PDCD4 sont capables de lier le facteur d'initiation de la traduction eIF4A mais sont dépourvues de la partie N-terminale, soit du domaine de liaison à l'ARN. Ainsi, bien qu'elles soient en mesure de lier eIF4A, leur action sur la traduction est surement réduite. En effet, le domaine de liaison à l'ARN est essentiel pour une inhibition efficace de la traduction dépendante de la coiffe et dépendante d'IRES. Nous avons également détecté ces altérations de PDCD4 dans des cellules souches/progénitrices saines et observé leur diminution au cours de la différenciation myéloïde. Ces mécanismes maintenus dans les cellules cancéreuses permettent de réduire l'effet de PDCD4. Ces formes tronquées sont probablement moins actives en tant que suppresseur de tumeur et pourraient définir un nouveau sous-groupe de patients atteints de LAM pour lesquels PDCD4 ne serait pas pleinement actif.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.000
metaresearch head score (Gemma)0.000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Bench or experimental · Consensus signal: Bench or experimental
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.001
Threshold uncertainty score0.003

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0000.000
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.000
Bibliometrics0.0000.000
Science and technology studies0.0000.000
Scholarly communication0.0000.000
Open science0.0000.000
Research integrity0.0000.000
Insufficient payload (model declined to judge)0.0010.000

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.011
GPT teacher head0.268
Teacher spread0.257 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designBench or experimental
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations0
Published2024
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