Alterations in Circulating T-Cell Subsets with Gut-Homing/Residency Phenotypes Predict HIV-1 Status and Subclinical Atherosclerosis
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Antiretroviral therapy (ART) controls HIV-1 replication in people with HIV-1 (PWH), but immunological restauration is not achieved at mucosal barriers. Intestinal integrity impairment fuels microbial translocation and chronic immune activation, thus heightening the cardiovascular disease (CVD) risk. Here, we sought to identify novel immunological predictors of the HIV and CVD status in the peripheral blood of ART-treated PWH (HIV + ; n=42) and uninfected participants (HIV-; n=40) of the Canadian HIV and Aging Cohort Study (CHACS), with/without subclinical coronary atherosclerotic plaques, measured by Coronary Computed Tomography Angiography as total plaque volume (TPV, mm 3 ). PBMCs were analyzed by flow cytometry for the expression of T-cell lineage (CD45, CD3, CD4, CD8αα, CD8αβ, TCRαβ, TCRγδ), epithelial cell (EpCAM/CD326), activation (HLA-DR), and gut-homing/residency markers (CD69, CD196/CCR6, CD199/CCR9, CD49d/Itgα4, CD103/ItgαE, Itgβ7). CellEngine supervised clustering of the flow cytometry data revealed profound alterations in the CD3 + T-cell pool in relationship with the HIV status, with the accumulation of peculiar CD8 + TCRαβ + and TCRγδ + cells, to the detriment of CD4 + TCRαβ + subsets. FlowJo manual gating further identified CD4 + T-cell subsets with peculiar CD326 + CD69 + CCR6 + ItgαE + and CCR6 + Itgβ7 - phenotypes that were increased in frequency in HIV + versus HIV - participants, together with a decreased frequency of CD8 + T-cells with an intraepithelial lymphocyte (IEL)-like CD3 + CD4 - TCRαβ + TCRγδ - CD8αα + CD8αβ - phenotype. Finally, multivariate logistic regression revealed the predictive capacity of specific T-cell subsets regarding the HIV/CVD status, and TPV values. Of particular relevance, we identified ItgαE + CD8 + , ItgαE - CD8 + , CCR6 + CD4 + , and CCR6 + Itgβ7 - CD4 + T-cell subsets as strong positive predictors of atherosclerotic plaque volume in crude models or upon adjustment for HIV/CVD confounding factors.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».