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Enregistrement W4404731945 · doi:10.1101/2024.11.25.24317882

Variable selection for competing risk regression models: recommendations for analyzing data from epidemiological studies

2024· preprint· en· W4404731945 sur OpenAlexaff
Jimmy Mullaert, Sandra Schmeller, Peter C. Austin, Aurélien Latouche

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueStatistical Methods and Inference
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpidemiologyRegression analysisSelection (genetic algorithm)Computer scienceModel selectionRegressionVariable (mathematics)EconometricsData scienceStatisticsMedicineArtificial intelligenceMathematicsMachine learning

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract When fitting competing risks regression models, a variety of variable selection methods exist, including backward selection on the subdistribution hazard, on the cause-specific hazards, and penalized methods. However, a benchmark study comparing these different procedures is lacking. We conducted an extensive simulation study to compare three variable selection procedures in terms of both model selection ability and predictive accuracy. 5120 datasets were simulated in various conditions aiming at being representative of real applications in clinical epidemiology. Results show that the performance of backward selection procedure can be affected by implementation choices. Even for scenarios with a high numbers of events per variable (EPV), the true model is rarely identified by any of the selection procedures. Survival predictions were assessed with time-dependent AUC and show similar performances for all methods. We also provided an application on stem cell transplanted patients in hematology. We concluded that the identification of the true model in competing risk regression is a very difficult task, and suggest some recommendations to analysts: (1) to report event per variable for the event type of interest and (2) to use multiple methods to deal with model uncertainty and avoid implementation pitfalls.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,145
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,460
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,855
Score d'incertitude au seuil0,768

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1450,460
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0040,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0060,006
Bibliométrie0,0080,007
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0050,005
Science ouverte0,0090,003
Intégrité de la recherche0,0060,011
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0110,007

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,587
Tête enseignante GPT0,524
Écart entre enseignants0,063 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomaineMéthodes
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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Résumé présentoui

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