Biochemistry and differential mechanistic activity of antimicrobial lipopeptides from plant pathogen antagonists from the genus <i>Bacillus</i>
Notice bibliographique
Résumé
Bacteria of the Bacillus genus produce various antimicrobial compounds that are effective against several plant pathogens. These Bacillus strains are proven plant pathogen antagonists, which produce cyclic lipopeptides (CLP) as a key group of antimicrobial compounds. Fengycins, iturins and surfactins are the three main families of CLP, which share a similar structure of an oligopeptide ring attached to a lipid tail. The proposed direct mechanisms of activity for CLP are their effects on the membranes of bacterial and fungal pathogens. These typically result in changes in the cell membrane structure, leading to pore formation, increased permeability and/or other membrane effects. The exact mechanisms of interaction with plant pathogen biomembranes and resulting outcomes are dependent on the family of CLP present. The differential activity of CLP against plant pathogenic fungi, oomycetes and bacteria indicates that specific determinants are required for their activity. Strains of Bacillus produce varying amounts of CLP, as well as other antimicrobial metabolites, which can influence their spectrum of activity, in a synergistic, additive, or negative manner. Further understanding of the overall variability and spectrum of activity of these antimicrobials is essential to evaluate the short- and long-term efficacy, and therefore sustainability of Bacillus spp. as biocontrol agents.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».