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Enregistrement W4404863340 · doi:10.1080/07060661.2024.2425955

Biochemistry and differential mechanistic activity of antimicrobial lipopeptides from plant pathogen antagonists from the genus <i>Bacillus</i>

2024· article· en· W4404863340 sur OpenAlexaffvenue
Charlotte Bakker, Zina Barghouth, Serine Ramlawi, Tyler J. Avis

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAntimicrobialMicrobiologyPathogenBiologyBacillus (shape)GenusBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bacteria of the Bacillus genus produce various antimicrobial compounds that are effective against several plant pathogens. These Bacillus strains are proven plant pathogen antagonists, which produce cyclic lipopeptides (CLP) as a key group of antimicrobial compounds. Fengycins, iturins and surfactins are the three main families of CLP, which share a similar structure of an oligopeptide ring attached to a lipid tail. The proposed direct mechanisms of activity for CLP are their effects on the membranes of bacterial and fungal pathogens. These typically result in changes in the cell membrane structure, leading to pore formation, increased permeability and/or other membrane effects. The exact mechanisms of interaction with plant pathogen biomembranes and resulting outcomes are dependent on the family of CLP present. The differential activity of CLP against plant pathogenic fungi, oomycetes and bacteria indicates that specific determinants are required for their activity. Strains of Bacillus produce varying amounts of CLP, as well as other antimicrobial metabolites, which can influence their spectrum of activity, in a synergistic, additive, or negative manner. Further understanding of the overall variability and spectrum of activity of these antimicrobials is essential to evaluate the short- and long-term efficacy, and therefore sustainability of Bacillus spp. as biocontrol agents.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,189
Écart entre enseignants0,176 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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