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Enregistrement W4404870184 · doi:10.1016/j.jid.2024.10.613

Identification of miR-141 as a Regulator of Epidermal Homeostasis

2024· article· en· W4404870184 sur OpenAlexafffund
Diane‐Lore Vieu, Christelle Golebiewski, Cécile Gastaldi, Aude Foucher, Bernard Mari, Roger Rezzonico, Arnaud Droit, Martine Dumont, Philippe Bastien, Françoise Bernerd, Claire Marionnet

Notice bibliographique

RevueJournal of Investigative Dermatology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesAgence Nationale de la RechercheUniversité Côte d’AzurUniversité Laval
Mots-clésRegulatorIdentification (biology)HomeostasisMaster regulatorBiologyComputational biologyCell biologyGeneticsTranscription factorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MicroRNAs, small endogenous noncoding RNAs, are involved in the regulation of epidermal homeostasis. Among them, miR-203 was the most described and expressed in human epidermis, promoting keratinocyte (KC) differentiation by repressing genes involved in proliferation. To identify other microRNAs involved in this process, the miRNomes of normal human KCs cultured in monolayer (2-dimensional) or in 3-dimensional reconstructed skin were compared. Besides miR-203, miR-141 was one of the most expressed microRNAs in 3-dimensional culture and was overexpressed in 3-dimensional versus 2-dimensional condition, that is, during KC differentiation. Functional experiments revealed that, mostly expressed in the basal layer, miR-141 decreased KC proliferation and clonogenicity while promoting differentiation. Target prediction algorithm coupled with transcriptomic data of KCs overexpressing miR-141 as well as 3' untranslated region luciferase assays highlighted CCND2 mRNA as a direct target of miR-141, leading to its downregulation by miR-141 overexpression. Finally, CCND2 silencing decreased KC proliferation and induced differentiation, revealing that miR-141 action was mediated by CCND2. MiR-141 features were also compared with those of miR-203 in parallel experiments. Although miR-141 displayed functions similar to those of miR-203, it exhibited different localization and targets, suggesting a joint participation of miR-141 and miR-203 in engaging and maintaining KC toward differentiation, respectively.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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