Mapping biosynthesis pathway of natural folate during <i>Lactiplantibacillus plantarum</i> subsp. <i>plantarum</i> fermentation in purple cabbage by transcriptomic analysis
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Folate is an important one-carbon cycle donor involved in the synthesis of purines, thymine, pantothenic acid, serine and glycine. The present study aimed to explore the capacity of Lactiplantibacillus plantarum subsp. plantarum (L. plantarum subsp. plantarum) to synthesize folate in fermenting MRS and purple cabbage juice (PCJ). The mechanism underlying folate biosynthesis was investigated by transcriptomics. We aimed to find important genes and transcription factors involved in folate production by analyzing gene expression during L. plantarum subsp. plantarum fermentation. RESULTS: The results showed a 44% increase in total folate content in the PCJ medium, with 5-methyltetrahydrofolate (5-MTHF) contributing to a substantial 28% of this increase, whereas no folate was detected during MRS fermentation. The mechanism of folate production during the fermentation involved the coordinated regulation of multiple genes. The expression of some key genes (aroC, pabA, folE, folA and MTHFR) was upregulated during fermentation, and the expression of MTHFR, a gene related to 5-MTHF synthesis, was increased by 8.4 times. These genes play roles in different steps of the folate synthesis pathway, including substrate synthesis, metabolic regulation and catalytic reactions. CONCLUSION: Our results revealed the expression of all genes involved in the biosynthesis of 5-MTHF during L. plantarum subsp. plantarum fermentation, indicating the integrity of its biosynthetic pathway. The findings provide a scientific basis for folate production by optimizing fermentation conditions, further helping research on folate synthesis in other fermented foods. © 2024 Society of Chemical Industry.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».