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Enregistrement W4404909541 · doi:10.1016/j.seppur.2024.130877

Application of machine learning tools to study the synergistic impact of physicochemical properties of peptides and filtration membranes on peptide migration during electrodialysis with filtration membranes

2024· article· en· W4404909541 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueSeparation and Purification Technology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMachine Learning in Bioinformatics
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesUniversité Laval
Mots-clésElectrodialysisMembraneFiltration (mathematics)ChemistryPeptideChromatographyChemical engineeringBiochemistryEngineeringMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The present study aimed to explore the application of machine learning-based tools to study the impact of physicochemical properties of peptides and filtration membranes (FM) on peptide migration during electrodialysis with filtration membranes (EDFM). A total of 14 membranes characterized in terms of 10 physicochemical properties were employed to evaluate the selective migration of cationic and anionic peptides from a tryptic hydrolysate of whey protein isolate well characterized by chemometric and bioinformatic methods. Two machine learning approaches were compared: Decision Tree (DT) and Binary Greedy Network (BGN). Based on the feature selection and model performance results, DT appeared to be the most appropriate approach to generate explanatory models of peptide migration. From the selected DT models, selective migration patterns associated with specific physicochemical properties of peptides and FMs were established for the first time. The migration of anionic peptides was positively affected by higher average peak-to-valley roughness (Rz) values and macropores distribution in the filtrating layer (Mp-FL), where S11N+ and PES300 were the FMs providing the highest recovery of this type of peptides, particularly for those with isoelectric point (pI) values lower than 4.407 (IDALNENK, KYLLFCMENSAEPEQSLACQCLVRTPEVD, SLAMAASDISLLDAQSAPL, SLAMAASDISLLDAQSAPLR, TDYKKYLLFCMENSAEPEQ, TPEVDDEALEK, TPEVDDEALEKFDK, VLVLDTDYK, and VYVEELKPTPEGDLEILLQK) which reached average recovery rates of 16.617 and 4.556 %, respectively. Regarding the migration of cationic peptides, this was mainly affected by other membrane characteristics such as volumetric porosity (Vp) and zeta potential (ZP), as well as peptide parameters such as polar residue content, pI, and leucine content. S11, S11SO3-, PES100, and PES300 were the FMs with the highest selective recovery rate for 7 out of 11 cationic peptides (ALPHMIR, IPAVFK, PMHI, PMHIR, TKIPAVF, TKIPAVFK, and VGINYWLAHK) with average values between 2.149 to 4.328 %. This novel DT-based approach represents a suitable tool for studying peptide migration, choosing the most appropriate FMs for selective bioactive peptide migration during EDFM, and understanding the phenomena involved in their migration process.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,373

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle