<i>N</i> -6-methyladenosine (m6A) promotes the nuclear retention of mRNAs with intact 5′ splice site motifs
Notice bibliographique
Résumé
In humans, misprocessed mRNAs containing intact 5′ Splice Site (5′SS) motifs are nuclear retained and targeted for decay by ZFC3H1, a component of the Poly(A) Exosome Targeting complex, and U1-70K, a component of the U1 snRNP. In S. pombe , the ZFC3H1 homolog, Red1, binds to the YTH domain–containing protein Mmi1 and targets certain RNA transcripts to nuclear foci for nuclear retention and decay. Here we show that YTHDC1 and YTHDC2, two YTH domain-containing proteins that bind to N -6-methyladenosine (m6A) modified RNAs, interact with ZFC3H1 and U1-70K, and are required for the nuclear retention of mRNAs with intact 5′SS motifs. Disruption of m6A deposition inhibits both the nuclear retention of these transcripts and their accumulation in YTHDC1-enriched foci that are adjacent to nuclear speckles. Endogenous RNAs with intact 5′SS motifs, such as intronic poly-adenylated transcripts, tend to be m6A-modified at low levels. Thus, the m6A modification acts on a conserved quality control mechanism that targets misprocessed mRNAs for nuclear retention and decay.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».