A rapid CAT transformation protocol and nuclear transgene expression tools for metabolic engineering in Cyanidioschyzon merolae 10D
Notice bibliographique
Résumé
The eukaryotic red alga Cyanidioschyzon merolae 10D is an emerging algal host for synthetic biology and metabolic engineering. Its small nuclear genome (16.5 Mb; 4775 genes), low intron content (39), stable transgene expression, and capacity for homologous recombination into its nuclear genome make it ideal for genetic and metabolic engineering endeavors. Here, we present an optimized transformation and selection protocol, which yields single chloramphenicol-resistant transformants in under two weeks. Transformation dynamics and a synthetic modular plasmid toolkit are reported, including several new fluorescent reporters. Techniques for fluorescence reporter imaging and analysis at different scales are presented to facilitate high-throughput screening of C. merolae transformants. We use this plasmid toolkit to overexpress the Ipomoea batatas isoprene synthase and demonstrate the dynamics of engineered volatile isoprene production during different light regimes using multi-port headspace analysis coupled to parallel photobioreactors. This work seeks to promote C. merolae as an algal system for metabolic engineering and future sustainable biotechnological production.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».