Genomic structural variation and herbicide resistance
Notice bibliographique
Résumé
The coinciding increase in genomics resources for weedy plant species and herbicide resistance evolution has led to a rapid expansion of our understanding of the relationship between genomic structural variation and herbicide resistance mechanisms. Since the first discovery of 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase ( EPSPS) copy number variation conferring glyphosate resistance in Amaranthus palmeri, we have seen rapid convergent evolution of the same herbicide-resistance mechanism in eleven diverse weed species by a variety of unique structural variant-generating mechanisms. These mechanisms include extrachromosomal circular DNA replication, unequal crossing over, and subtelomeric duplication. More recently, target-site duplication has been found to cause resistance for other herbicides with different modes of action, including acetyl-CoA carboxylase (ACCase) inhibitors and glutamine synthetase inhibitors. Additionally, the first transposon-generated structural variants that confer herbicide resistances are beginning to be discovered. This review summarizes our current understanding of structural variation in agronomic weed genomes as it relates to herbicide resistance and emphasizes necessary future research to clarify the size, nature, and mechanisms that give rise to genomic structural variation. While we limit our review to herbicide resistance traits, this work also highlights the importance of structural variation as a critical component of total genetic diversity and its importance for the rapid evolution of novel traits.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».